Proteomic analysis of heart tissue affected by amyloidosis. Comparison of analysis results of frozen tissue sections and formaldehyde-fixed samples (FFPE)

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F23%3A00576364" target="_blank" >RIV/61388963:_____/23:00576364 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://lcms.cz/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/abstrakty_sbornik_final_2023_3640c3638d/abstrakty_sbornik_final_2023.pdf" target="_blank" >https://lcms.cz/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/abstrakty_sbornik_final_2023_3640c3638d/abstrakty_sbornik_final_2023.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Proteomická analýza srdeční tkáně postižené amyloidózou. Porovnání výsledků analýzy řezů ze zmražené tkáně a vzorků fixovaných formaldehydem (FFPE)

Original language description

Amyloidóza je heterogenní infiltrativní onemocnění charakterizované ukládáním nerozpustných forem proteinů (amyloidů) v extracelulárních prostorech různých tkání. Může být součástí systémového amyloidového onemocnění nebo se rozvinout samostatně. Doposud bylo objeveno 36 různých forem proteinových depozic. Infiltrace a depozice může probíhat i v myokardu. Nejčastějšími typy v srdeční tkáni jsou AL a TTR amyloidóza. První varianta je způsobená depozicí monoklonálního kappa nebo lambda lehkého řetězce protilátek. TTR amyloidózu způsobuje depozice proteinu transthyretinu. Pro diagnostiku tohoto onemocnění je důležitá typizace. Proteomické techniky umožňují citlivou charakterizaci postižené tkáně a určení proteinu, který amyloidy tvoří. To je podstatné pro následnou terapii.nMateriálem pro proteomickou analýzu jsou vzorky endomyokardiálních biopsií, které mohou být zpracovány ve formě nativních mražených vzorků nebo řezů z formaldehydem fixovaných tkání (FFPE). V obou případech se jedná o nedostatkové vzorky, které mohou být použity pro zpracovány pomocí histologických nebo jiných technik. Z toho důvodu je důležité používat minimální množství vzorků pro správnou typizaci onemocnění.nV naší studii zpracováváme oba typy vzorků vhodnými proteomickými metodami. V případě vzorků ze zmražené tkáně používáme metodu štěpení proteinů na filtru (eFASP). Pro zpracování vzorků FFPE používáme metodiku se zapojením detergentu RapiGest. Obě metodiky identifikují ve vzorcích srdeční tkáně proteiny a obě metody dokáží zachytit proteiny, které amyloid mohou způsobit.n

Czech name

Proteomická analýza srdeční tkáně postižené amyloidózou. Porovnání výsledků analýzy řezů ze zmražené tkáně a vzorků fixovaných formaldehydem (FFPE)

Czech description

Amyloidóza je heterogenní infiltrativní onemocnění charakterizované ukládáním nerozpustných forem proteinů (amyloidů) v extracelulárních prostorech různých tkání. Může být součástí systémového amyloidového onemocnění nebo se rozvinout samostatně. Doposud bylo objeveno 36 různých forem proteinových depozic. Infiltrace a depozice může probíhat i v myokardu. Nejčastějšími typy v srdeční tkáni jsou AL a TTR amyloidóza. První varianta je způsobená depozicí monoklonálního kappa nebo lambda lehkého řetězce protilátek. TTR amyloidózu způsobuje depozice proteinu transthyretinu. Pro diagnostiku tohoto onemocnění je důležitá typizace. Proteomické techniky umožňují citlivou charakterizaci postižené tkáně a určení proteinu, který amyloidy tvoří. To je podstatné pro následnou terapii.nMateriálem pro proteomickou analýzu jsou vzorky endomyokardiálních biopsií, které mohou být zpracovány ve formě nativních mražených vzorků nebo řezů z formaldehydem fixovaných tkání (FFPE). V obou případech se jedná o nedostatkové vzorky, které mohou být použity pro zpracovány pomocí histologických nebo jiných technik. Z toho důvodu je důležité používat minimální množství vzorků pro správnou typizaci onemocnění.nV naší studii zpracováváme oba typy vzorků vhodnými proteomickými metodami. V případě vzorků ze zmražené tkáně používáme metodu štěpení proteinů na filtru (eFASP). Pro zpracování vzorků FFPE používáme metodiku se zapojením detergentu RapiGest. Obě metodiky identifikují ve vzorcích srdeční tkáně proteiny a obě metody dokáží zachytit proteiny, které amyloid mohou způsobit.n

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

10406 - Analytical chemistry

Project

<a href="/en/project/LX22NPO5104" target="_blank" >LX22NPO5104: National Institute for Research of Metabolic and Cardiovascular Diseases</a><br>

Continuities

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2023

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů