Role of Distal Arginine in Early Sensing Intermediates in the Heme Domain of the Oxygen Sensor FixL

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F06%3A00050741" target="_blank" >RIV/61388971:_____/06:00050741 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Role of Distal Arginine in Early Sensing Intermediates in the Heme Domain of the Oxygen Sensor FixL

Original language description

FixL is a bacterial heme-based oxygen sensor, in which release of oxygen from the heme domain leads to activation of an associated kinase domain.The conserved arginine 220 residue is suggested to play a key role in the signal transduction mechanism. To assess the role of this residue in the dynamics and properties of the initial intermediates in ligand release, we have investigated the effects of R220X (X = I, Q, E, H, or A) mutations in the FixLH heme domain on the dynamics and spectral properties of the heme using femtosecond transient absorption spectroscopy. Along with molecular dynamics simulations, our results imply that the presence of the conserved arginine residue at position 220 strongly determines the strain on the heme in the initially formed transmission intermediate and the "oxygen cage" properties of the heme pocket

Czech name

ole distálního argininu v detekci časných intermediátů v hemové doméně kyslíkového senzoru FixL

Czech description

FixL je bakteriální kyslíkový senzor skládající se z hemové a kinázové domény. Konformační změna hemové domény v důsledku vazby kyslíku na hemovou skupinu reguluje aktivitu sousedící kinázové domény. Předpokládá se, že konzervovaný arginin 220 hraje v mechanismu signální transdukce klíčovou roli. Pro získání detailního popisu role tohoto zbytku v dynamice a vlastnostech intermediátů po uvolnění ligandu jsme testovali dynamiku a spektrální vlastnosti hemové skupiny u série mutací R220X (X = I, Q, E, H, aA) pomocí femtosekundové spektroskopie. Výsledky měření, ve shodě s molekulárně dynamickou simulací, prokázaly, že konzervovaný arginin v pozici 220 silně ovlivňuje posun hemové skupiny. Navíc se podílí na ?zadržování? molekulárního kyslíku v hemové dutině FixLH domény

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Biochemistry

ISSN

0006-2960

e-ISSN

—

Volume of the periodical

45

Issue of the periodical within the volume

19

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

9

Pages from-to

6018-6026

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—