Abundance, depth distribution, and composition of aerobic bacteriochlorophyll a-producing bacteria in four basins of the central Baltic Sea

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F08%3A00315781" target="_blank" >RIV/61388971:_____/08:00315781 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12640/08:00009206

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Abundance, depth distribution, and composition of aerobic bacteriochlorophyll a-producing bacteria in four basins of the central Baltic Sea

Original language description

The abundance, vertical distribution, and diversity of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria (AAP) were studied at four basins of the Baltic Sea. AAP were enumerated by infrared epifluorescence microscopy, and their diversity was analyzed by using pufM gene clone libraries. In addition, numbers of CFU containing the pufM gene were determined, and representative strains were isolated. Both approaches indicated that AAP reached maximal abundance in the euphotic zone. Maximal AAP abundance was 2.5 x 105cells mL-1 (11% of total prokaryotes) or 1.0 x 103 CFU mL-1 (9 to 10% of total CFU). Environmental pufM clone sequences were grouped into 11 operational taxonomic units phylogenetically related to cultivated members of the Alpha-, Beta-, and Gammaproteobacteria. In spite of varying pufM compositions, five clones were present in all libraries

Czech name

Množství, hloubkový profil a druhové složení aerobních fototrofních bakterií v Baltském moři

Czech description

Rozšíření a druhové složení aerobních fototrofních bakterií (AAP) bylo analyzováno ve čtyřech proláklinách Baltského moře. Množství AAP bakterií bylo určeno pomocí infračervené epifluorescenční mikroskopie, jejich druhové složení potom pomocí klonovacíchknihoven genu pufM. AAP bakterie se vyskytovaly v eufotické zóně na všech studovaných stanicích, jejich počty dosahovaly maximálně 2.5 x 105 buněk mL-1 (11% všech prokaryot). Environmentální sekvence byly rozčleněny do 11 pracovních taxonomických skupin, které byly příbuzné kultivovaným zástupcům Alfa-, Beta-, and Gamaproteobakterií. Přes značnou proměnlivost, pět základních forem pufM genu bylo přítomno ve všech knihovnách. 25-30% všech klonů tvořily sekvence příbuzné pufM genu Jannaschia sp.. Pravděpodobně betaproteobakteriální geny byly zaznamenány na třech stanicích, klony přibuzné Loktanelle vestfoldensis představovaly 40% celkových genů v Gotlandské proláklině

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Applied and Environmental Microbiology

ISSN

0099-2240

e-ISSN

—

Volume of the periodical

74

Issue of the periodical within the volume

14

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

7

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000257733600019

EID of the result in the Scopus database

—