Molecular kit for early detection of microbial contaminations in algae cultures.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F22%3A00558737" target="_blank" >RIV/61388971:_____/22:00558737 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/68081707:_____/22:00558737 RIV/67985939:_____/22:00558737

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Molekulární kit pro časnou detekci kritických mikrobiálních kontaminant řasových kultur

Original language description

V rámci projektu BIOCIRTECH byl vytvořen molekulární kit pro včasnou detekcinmikrobiálních kontaminant řasových kultur. Cílem bylo získat vysoce citlivou metoduns relativně nízkou časovou náročností na provedení, proto byla zvolena metoda real-timenPCR (též kvantitativní neboli qPCR) s cílenou detekcí širokého spektra řasovýchnkontaminantů. Metodou lze detekovat buď širší skupiny kontaminantů (Chlorophyta,nSAR), nebo konkrétní nižší taxony (Chytridiomycota, Blastocladiomycota, Labyrintula,nRotifera, Euplaesiobystra, Chlorella). Kit je koncipován tak, aby byl využitelný univerzálněnpro řadu běžně kultivovaných mikrořas (Haematococcus, Chlorella, Phaeodactylum,nScenedesmus, Dunaliella) a aby byl modulární. V tomto ohledu výběr konkrétníchndetekčních reakcí spočívá na uživateli: může testovat všechny v kitu dostupnénkontaminanty, nebo si může vybrat jen určité reakce pro konkrétní skupinunpředpokládaných kontaminant.

Czech name

Molekulární kit pro časnou detekci kritických mikrobiálních kontaminant řasových kultur

Czech description

V rámci projektu BIOCIRTECH byl vytvořen molekulární kit pro včasnou detekcinmikrobiálních kontaminant řasových kultur. Cílem bylo získat vysoce citlivou metoduns relativně nízkou časovou náročností na provedení, proto byla zvolena metoda real-timenPCR (též kvantitativní neboli qPCR) s cílenou detekcí širokého spektra řasovýchnkontaminantů. Metodou lze detekovat buď širší skupiny kontaminantů (Chlorophyta,nSAR), nebo konkrétní nižší taxony (Chytridiomycota, Blastocladiomycota, Labyrintula,nRotifera, Euplaesiobystra, Chlorella). Kit je koncipován tak, aby byl využitelný univerzálněnpro řadu běžně kultivovaných mikrořas (Haematococcus, Chlorella, Phaeodactylum,nScenedesmus, Dunaliella) a aby byl modulární. V tomto ohledu výběr konkrétníchndetekčních reakcí spočívá na uživateli: může testovat všechny v kitu dostupnénkontaminanty, nebo si může vybrat jen určité reakce pro konkrétní skupinunpředpokládaných kontaminant.

Type

G_funk - Functional sample

CEP classification

—

OECD FORD branch

10608 - Biochemistry and molecular biology

Project

<a href="/en/project/TN01000048" target="_blank" >TN01000048: Biorefining as circulation technology</a><br>

Continuities

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2022

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

TN01000048/3-V13

Numerical identification

TN01000048/3-V13

Technical parameters

Funkční vzorek spočívá v nově vyvinuté a optimalizované metodě PCR v reálném čase (qPCR) se sekvenčně specifickými sondami typu TaqMan. Celkem sedm sad specifických primerů a sond umožňuje senzitivní a specifickou detekci kritických kontaminant běžně kultivovaných mikrořas. Cílem detekce (amplifikace) je mnohakopiový gen 18S rDNA. Efektivita reakcí se pohybuje nejčastěji mezi 95 a 105 %, limit detekce je, s výjimkou dvou případů, mezi 6 a 200 molekulami v reakci. Byla vytvořena plazmidová kontrola izolace DNA s vlastní optimalizovanou reakcí.

Economical parameters

Výrobek je použitelný v biotechnologických provozech jako prevence proti kontaminacím. Využitím se zvýší zajištění bezpečnosti a ochrany provozu.

Application category by cost

—

Owner IČO

68081707

Owner name

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Owner country

CZ - CZECH REPUBLIC

Usage type

V - Výsledek je využíván vlastníkem

Licence fee requirement

—

Web page

—