Modelling of carbohydrate?aromatic interactions: ab initio energetics and force field performance
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389013%3A_____%2F05%3A00042976" target="_blank" >RIV/61389013:_____/05:00042976 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/60461373:22330/05:00022551
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Modelling of carbohydrate?aromatic interactions: ab initio energetics and force field performance
Original language description
The CH/.pi. interactions between aromatic amino acid residues and carbohydrates play a significant role in the enzymatic reactions of glycosidases and in other carbohydrate binding proteins. The paper presents ab initio interaction energies calculated for 20 carbohydrate?aromatic complexes derived from six ultra-high resolution X-ray structures of glycosidases and carbohydrate-binding proteins. The results show that the CH/.pi. interactions are responsible for stacking and orientation of carbohydrates with respect to the aromatic residues.
Czech name
Modelování interakcí mezi uhlovodíky a aromatickými skupinami: ab initio výpočty
Czech description
CH/.pi. interakce mezi aromatickými skupinami a uhlovodíky hrají důležitou roli v enzymatických reakcích v glykosidázách a dalších proteinech vážících uhlovodíky. Článek presentuje ab initio výpočty interakčních energií ve dvaceti modelových komplexech uhlovodíků s aromatickými residui odvozených ze šesti struktur glykosidáz a uhlovodíky vázajících proteinů stanovených spolehlivě pomocí difrakce rentgenového záření. Výsledky ukazují, že CH/.pi. interakce jsou odpovědné za polohu a vzájemnou orientaci uhlovodíkových a aromatických kruhů.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
CD - Macromolecular chemistry
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2005
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Journal of Computer-Aided Molecular Design
ISSN
0920-654X
e-ISSN
—
Volume of the periodical
19
Issue of the periodical within the volume
12
Country of publishing house
NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS
Number of pages
5
Pages from-to
887-901
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—