L-fucose in crystal structures of IgG-Fc: Reinterpretation of experimental data
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389013%3A_____%2F08%3A00308572" target="_blank" >RIV/61389013:_____/08:00308572 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/68407700:21340/08:04151162
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
L-fucose in crystal structures of IgG-Fc: Reinterpretation of experimental data
Original language description
Inspection of the geometry of oligosaccharides covalently bound to IgG-Fc reveals poor agreement with electron density in most of the structures deposited in the Protein Data Bank. Our study shows discrepancies mainly for L-fucose. Revision of refinementof two structures containing the Fc-fragment solved at the highest resolution brings clear evidence for ?-L-fucosylation instead of ?-L-fucosylation as it was claimed in most of the deposited structures in the Protein Data Bank containing the Fc-fragment, and also in the original structures selected for re-refinement.
Czech name
L-fukoza v krystalových strukturách IgG-Fc: reinterpretace experimentálních dat
Czech description
Kontrola geometrie oligosacharidů kovalentně vázaných na IgG-Fc odhaluje ve většině krystalových struktur v PDB špatnou shodu s elektronovou hustotou. Tato studie poukazuje hlavně na L-fukozu. Revize upřesnění dvou struktur obsahujících Fc-fragment řešených s nejvyšším rozlišením přináší jasný důkaz pro ?-L-fukozylaci namísto ?-L-fukozylace, jak je tvrzeno ve většině zveřejněných struktur a rovněž ve strukturách vybraných pro zpřesnění.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
CD - Macromolecular chemistry
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA305%2F07%2F1073" target="_blank" >GA305/07/1073: Molecular interactions of polymers for biomedical applications</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>R - Projekt Ramcoveho programu EK
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Collection of Czechoslovak Chemical Communications
ISSN
0010-0765
e-ISSN
—
Volume of the periodical
73
Issue of the periodical within the volume
5
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
8
Pages from-to
608-615
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—