Comparison between mitochondrial and chloroplast DNA variation in the native range of Silene vulgaris

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F04%3A00109140" target="_blank" >RIV/61389030:_____/04:00109140 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Comparison between mitochondrial and chloroplast DNA variation in the native range of Silene vulgaris

Original language description

A detailed survey of mitochondrial and chloroplast diversity in eight populations of Silene vulgaris from Central Europe was conducted for comparison with previously published data on diversity from S. vulgaris populations in the introduced range. Mitochondrial DNA (mtDNA) variation around the coxI gene was assessed with Southern blotting/restriction fragment length polymorphism methods. Chloroplast variation was assessed by sequencing the intergenic spacer separating the trnH and psbA genes. Thirty mtDNA haplotypes and 24 chloroplast DNA (cpDNA) haplotypes were found within 86 individuals. The overall genetic diversity h (0.941 for mitochondrial, and 0.893 for chloroplast markers) and within-population diversity were higher than reported in previous population studies of S. vulgaris in the USA and Europe. The frequency of private alleles was surprisingly high - more than 90% for both kinds of markers. Most of our populations were large and located in relatively undisturbed meadows,...

Czech name

Porovnání proměnlivosti chloroplastové a mitochondriální DNA v původním areálu Silene vulgaris

Czech description

Provedli jsme podrobný průzkum mitochondriální (mtch) a chloroplastové (cp) DNA diversity v osmi populacích Silene vulgaris ze Střední Evropy s cílem porovnání se dříve publikovanými údaji o této diverzitě v introdukovaném areálu S. vulgaris v USA. Variabilita mtch DNA v okolí genu coxI byla stanovena pomocí Southernovy hybridizace a RFLP. Variabilita cpDNA byla určena sekvenováním intergenové oblasti mezi geny psbA a trnH. Nalezli jsme 30 různých mtch haplotypů a 26 různých chloroplastových haplotypů mezi 86 jedinci. Celková genetická diverzita h (0,941 pro mtch markery a 0,893 pro cp markery) a vnitropopulační diverzita byly byly vyšší než u předcházejících popolačních studií S. vulgaris v Evropě či USA. Zjistili jsme take překvapivě vysolý podíl privátních alel ? vice než 90% u obou typů markerů. Většina námi sledovaných populací měla značnou velikost a byla umístěna v realtivně zachovalých lučních porostech. Pomalá rychlost výměny (turnover) evropských populace je zvažována jako...

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Molecular Ecology

ISSN

0962-1083

e-ISSN

—

Volume of the periodical

13

Issue of the periodical within the volume

10

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

11

Pages from-to

2909-2919

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—