Transcriptome analysis of haploid male gametophyte development in Arabidopsis

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F04%3A00110109" target="_blank" >RIV/61389030:_____/04:00110109 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216208:11310/04:8041

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Transcriptome analysis of haploid male gametophyte development in Arabidopsis

Original language description

The haploid male gametophyte generation of flowering plants consists of two- or three-celled pollen grains. This functional specialization is thought to be a key factor in the evolutionary success of flowering plants. Moreover, pollen ontogeny is also anattractive model in which to dissect cellular networks that control cell growth, asymmetric cell division and cellular differentiation. Our objective, and an essential step towards the detailed understanding of these processes, was to comprehensively define the male haploid transcriptome throughout development.

Czech name

Analýza transkriptomu vyvíjejícího se haploidního samčího gametofytu Arabidopsis thaliana

Czech description

Haploidní samčí gametofyt semenných rostlin je tvořen dvoj- či trojbuněčným pylovým zrnem. Předpokládá se, že tato funkční specializace je klíčovým faktorem evolučního úspěchu semenných rostlin. Pylová ontogenese je navíc i atraktivním modelem pro studium mechanismů kontroly buněčného růstu, asymetrického buněčného dělení a buněčné diferenciace. Naším cílem je přehledně popsat haploidní transkriptom a jeho změny během vývoje pylu. Zavedli jsme metodu isolace spor v různých vývojových stádiích samčího gametofytu Arabidopsis a použili jsme genový čip Affymetrix ATH1 k identifikaci 13 977 genů aktivních v samčím gametofytu, z nichž 9,7 % bylo specifických. Přechod z dvojbuněčného do trojbuněčného vývojového stadia byl doprovázen poklesem počtu různých mRNA a zvýšením zastoupení specifických transkriptů. Popsané expresní profily regulačních bílkovin a přítomnost zřetelných clusterů koexprimovaných genů ukazuje na komponenty gametofytických regulačních sítí. Integrace transkriptomických...

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Genome Biology

ISSN

1465-6914

e-ISSN

—

Volume of the periodical

5

Issue of the periodical within the volume

-

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

13

Pages from-to

—

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—