Dissection of the nuclear genome of barley by chromosome flow sorting

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F06%3A00081790" target="_blank" >RIV/61389030:_____/06:00081790 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Dissection of the nuclear genome of barley by chromosome flow sorting

Original language description

Isolation of mitotic chromosomes using flow cytometry is an attractive way to dissect nuclear genomes into their individual chromosomal components or portions of them. This approach is especially useful in plants with complex genomes, where it offers a targeted and hence economical approach to genome analysis and gene cloning. In several plant species, DNA of flow-sorted chromosomes has been used for isolation of molecular markers from specific genome regions, for physical mapping using polymerase chainreaction (PCR) and fluorescence in situ hybridization (FISH), for integration of genetic and physical maps and for construction of chromosome-specific DNA libraries, including those cloned in bacterial artificial chromosome vectors. Until now, chromosome analysis and sorting using flow cytometry (flow cytogenetics) has found little application in barley (2n = 14, 1C ~ 5, 100 Mbp) because of the impossibility of discriminating and sorting individual chromosomes, except for the smallest c

Czech name

Rozdělení genomu ječmene tříděním chromozómů pomocí průtokové cytometrie

Czech description

Průtoková cytometrie představuje efektivní metodu pro izolaci chromozómů a analýzu jaderného genomu. Tato metoda je zvlášť využitelná u rostlin s komplexním genomem. U několika rostlinných druhů byla DNA tříděných chromozómů využita pro izolaci molekulárních markerů, pro fyzické mapování pomocí PCR a fluorescenční in situ hybridizaci, pro konstrukci chromozómově specifických knihoven. Analýza chromozómů a jejich třídění pomocí průtokové cytometrie u ječmene (2n = 14, 1C ~ 5, 100 Mbp) byla dosud málo použitelná pro nemožnost rozlišení a třídění jednotlivých chromozómů, kromě nejmenšího chromozómu 1H a některých translokovaných chromozómů. V této práci je ukázáno, že ditelosomické adiční linie linie pšenice-ječmen mohou být použity k třídění některých ramen chromozómů 2H-7H ječmene. Takto může být genom ječmene rozdělen na frakce, představující až 6-12% celkového genomu.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Theoretical and Applied Genetics

ISSN

0040-5752

e-ISSN

—

Volume of the periodical

113

Issue of the periodical within the volume

-

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

9

Pages from-to

651-659

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—