Chromosome-based genomics in cereals

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F07%3A00305105" target="_blank" >RIV/61389030:_____/07:00305105 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Chromosome-based genomics in cereals

Original language description

The cereals are of enormous importance to mankind. Many of the major cereal species - specifically, wheat, barley, oat, rye, and maize - have large genomes. Early cytogenetics, genome analysis and genetic mapping in the cereals benefited greatly from their large chromosomes, and the allopolyploidy of wheat and oats that has allowed for the development of many precise cytogenetic stocks. In the genomics era, however, large genomes are disadvantageous. Sequencing large and complex genomes is expensive, and the assembly of genome sequence is hampered by a significant content of repetitive DNA and, in allopolyploids, by the presence of homoeologous genomes. Dissection of the genome into its component chromosomes and chromosome arms provides an elegant solution to these problems. In this review we illustrate how this can be achieved by flow cytometric sorting. We describe the development of methods for the preparation of intact chromosome suspensions from the major cereals, and their analys

Czech name

Chromozómová genomika obilnin

Czech description

Obiloviny mají pro lidstvo nesmírný význam. Mnoho důležitých druhů obilovin ? pšenice, ječmen, oves, žito a kukuřice ? má však velký genom. Sekvenování takových genomů je nákladné. Velké zastoupení repetitivní DNA a přítomnost homeologních genomů u alopolyploidů je na překážku při sestavování geonomových sekvencí. Řešením tohoto problému může být rozdělení genomu na jednotlivé chromozómy, případně ramena chromozómů. Tato práce demonstruje využití průtokové cytometrie pro získávání tříděných chromozómů.Je popsán vývoj metod pro přípravu suspenze chromozómů obilovin, jejich analýza a třídění průtokovou cytometrií. Je vysvětleno, jaké obtížnosti v rozlišení chromozómů a jejich ramen musely být překonány s využitím existujících cytogenetických materiálů polyploidní pšenice a ovsa, zejména využití delečních a adičních chromozómových linií. Jsou také diskutovány aplikace tříděných chromozómů a uvedeny příklady demonstrující využitelnost chromozómů pro analýzy komplexních genomů obilovin, je

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Chromosome Research

ISSN

0967-3849

e-ISSN

—

Volume of the periodical

15

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

16

Pages from-to

51-66

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—