A physical map of the 1-gigabase bread wheat chromosome 3B

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F08%3A00322893" target="_blank" >RIV/61389030:_____/08:00322893 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

A physical map of the 1-gigabase bread wheat chromosome 3B

Original language description

As the staple food for 35% of the world's population, wheat is one of the most important crop species. To date, sequence- based tools to accelerate wheat improvement are lacking. As part of the international effort to sequence the 17- billion- base- pairhexaploid bread wheat genome ( 2n = 6x = 42 chromosomes), we constructed a bacterial artificial chromosome ( BAC)based integrated physical map of the largest chromosome, 3B, that alone is 995 megabases. A chromosome- specific BAC library was used to assemble 82% of the chromosome into 1036 contigs that were anchored with 1443 molecular markers, providing a major resource for genetic and genomic studies. This physical map establishes a template for the remaining wheat chromosomes and demonstrates the feasibility of constructing physical maps in large, complex, polyploid genomes with a chromosome- based approach.

Czech name

Fyzická mapa 1-gigabázového chromozómu 3B pšenice

Czech description

Jako základní potravina pro 35% světové populace je pšenice jednou z nejdůležitějších zemědělských plodin. Možnosti pro využití biotechnologických nástrojů založených na sekvenování DNA pro urychlení šlechtění doposud chybí. Jako součástí mezinárodního úsilí sekvenovat genom pšenice (2n = 6x = 42 chromozómů), který má 17 miliard párů bází, jsme připravili integrovanou fyzickou mapu největšího chromozómu 3B, který sám o sobě má 995 miliónů párů bází. Chromozómově-specifická knihovna klonovaná ve vektoruBAC byla použita k sestavení 82% délky chromozómu do 1036 kontigů, které byly ukotveny 1443 molekulárními markery. Tato fyzická mapa představuje unikátní materiál pro genetiku a genomiku pšenice. Její konstrukce je vzorem pro konstrukci fyzických map ostatních chromozómů pšenice a potvrzuje možnost konstruovat fyzické mapy velkých a složitých genomů s použitím tzv. chromozómové strategie.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LC06004" target="_blank" >LC06004: Integration of research activities to study the plant genome</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Science

ISSN

0036-8075

e-ISSN

—

Volume of the periodical

322

Issue of the periodical within the volume

5898

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

4

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000259680200047

EID of the result in the Scopus database

—