Primer R108 Performs Best in the RAPD Starin Typing of Three Aspergillus Species Frequently Isolated from Patients

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F06%3A00006292" target="_blank" >RIV/61989592:15110/06:00006292 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Primer R108 Performs Best in the RAPD Starin Typing of Three Aspergillus Species Frequently Isolated from Patients

Original language description

We evaluated the suitability of various primers for the RAPD (random amplified polymorphic DNA) accurate species identification and stran typing of Aspergillus clinical isolates. Five primers described previously were tested for their discriminatory power in three Aspergillus species (A. fumigatus, A. niger agg. and A. flavus - 23 clinical isolates and 2 reference strains). Clustering of RAPD fingerprints corresponded well with the identification based on morphological features. All isolates were resolved as different strains using the primer R108 thus can be considered to be a valuable, simple and powerful tool for identification and strain delineation of Aspergillus spp.

Czech name

Primer R108 je nejvhodnějí pro kneovou RAPD typizaci tří druhů aspergilů často izolovaných od pacientů.

Czech description

Vyhodnotili jsme vhodnost různých primerů pro přesnou kmenovou RAPD typizaci klinických izolátů aspergilů. Byla testována rozlišovací schopnost 5 dříve popsaných primerů u tří druhů aspergilů (A. fumigatus, niger agg. a flavus - 23 klinických izolátů a 2referenční kmeny). Shluková analýza RAPD fingerprintů dobře odpovídala jejich druhové identifikaci, založené na morfologických vlastnostech. Při použití primeru R108 a RAPD protokolu optimalizovaného pro termocykler Robocycler byly všechny izoláty rozlišeny jako odlišné kmeny. RAPD prováděnou s primerem R108 lze proto považovat za hodnotný, jednoduchý robustní nástroj pro identifikaci a rozlišení kmenů uAspergillus sp.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/NI7498" target="_blank" >NI7498: Rapid PCR detection and epidemiology of nosocomial invasive aspergillosis</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Folia Microbiologica

ISSN

0015-5632

e-ISSN

—

Volume of the periodical

51

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

5

Pages from-to

—

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—