MOLEonline

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F25%3A73631985" target="_blank" >RIV/61989592:15310/25:73631985 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://moleonline.cz/" target="_blank" >https://moleonline.cz/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
MOLEonline
Original language description
MOLEonline is an interactive, web-based tool designed to detect and analyse channels (pores and tunnels) within protein structures. The latest version of MOLEonline addresses the limitations of its predecessor by integrating the Mol* viewer for visualization and offering a streamlined, fully interactive user experience. The new features include colouring tunnels in the 3D viewer based on their physicochemical properties. A 2D representation of the protein structure and calculated tunnels is generated using 2DProts. Users can now store tunnels directly in the mmCIF file format, facilitating sharing via the community-standard FAIR format for structural data. In addition, the ability to store and load computation settings ensures the reproducibility of tunnel computation results. Integration with the ChannelsDB 2.0 database allows users to access precomputed tunnels.
Czech name
—
Czech description
—

Project
<a href="/en/project/LM2023055" target="_blank" >LM2023055: Czech National Infrastructure for Biological Data</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year
2025
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID
Webová aplikace MoleOnline
Technical parameters
Jedná se o aplikaci klient/server, kde na straně serveru je zapotřebí Apache web server s PHP a databázový server MySQL.Na straně klienta je pak vyžadovaný internetový prohlížeč v aktualizované verzi.
Economical parameters
Aplikace MOLEonline přináší ekonomický přínos zejména zkrácením času a snížením nákladů na analýzu proteinových struktur díky plně webovému, interaktivnímu prostředí a přístupu k předpočítaným datům z ChannelsDB 2.0. Umožněním snadného sdílení, opakovatelnosti výpočtů a využití standardizovaných formátů (FAIR, mmCIF) zvyšuje efektivitu výzkumu a urychluje přenos výsledků do aplikovaného výzkumu, například ve vývoji léčiv či biotechnologiích.
Owner IČO
61989592
Owner name
Univerzita Palackého Olomouc

Similar results(10)