New SNPs in the IGF2 gene and association between this gene and backfat thickness and lean meat content in Large White pigs

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F06%3A00092877" target="_blank" >RIV/62156489:43210/06:00092877 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/67985904:_____/06:00040915

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

New SNPs in the IGF2 gene and association between this gene and backfat thickness and lean meat content in Large White pigs

Original language description

IGF2-in3-G3072A is a causative mutation for paternally expressed QTL on the p arm of porcine chromosome 2 with substantial effect on muscle growth and backfat thickness. The linkage disequilibrium between IGF2-in3-G3072A and IGF2-in7-G162C (IGF2-NciI) infour breeds and associations between these polymorphisms and growth and meat performance in pigs of the Large White breed were analyzed. A significant effect of these polymorphisms on backfat thickness and lean meat content was found. In addition, we identified two new single nucleotide polymorphisms (SNPs) in intron 7 of the gene. The existence of complete linkage disequilibrium between IGF2-in3-G3072A locus in the population under study where the locus segregated and SNPs in intron 7 of the IGF2 genedetectable with simple and reliable PCR-RFLP techniques (G162C, C179G and G186T) offer possibilities to use these SNPs for genotyping of QTN in Large White and Landrace breeds.

Czech name

Nové SNP v genu IGF2 a asociace mezi tímto genem a výškou hřbetního tuku a obsahem libového masa u prasat plemene bílé ušlechtilé

Czech description

IGF2-in3-G3072A je kauzální mutace pro paternálně exprimovaný QTL na p raménku prasečího chromozomu 2 s významným vlivem na vývoj svalů a výšku hřbetního tuku. U čtyř plemen prasat byla sledována vazbová nerovnováha mezi IGF2-in3-G3072A a IGF2-in7-G162C(IGF2-Nci) a dále byla provedena asociační analýza mezi těmito polymorfismy a masnou užitkovostí prasat plemene bílé ušlechtilé. Byl prokázán signifikatní vliv těchto polymorfismů na výšku hřbetního tuku a obsah libového masa. Navíc byly v intronu 7 genuIGF2 nalezeny dva nové jednonukleotidové polymorfismy (SNP). Existence kompletní vazbové nerovnováhy mezi lokusem IGF2-in3-G3072A, segregujícím ve studované populaci, a SNP v intronu 7, které jsou jednoduše detekovatelné pomocí metody PCR-RFLP, nabízí možnost využití těchto SNP pro genotypizaci QTN u plemen Bílé ušlechtilé a Landrasa.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Animal Breeding and Genetics

ISSN

0931-2668

e-ISSN

—

Volume of the periodical

—

Issue of the periodical within the volume

123

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

4

Pages from-to

204-207

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—