Molecular markers of genetic variability in triticale varieties registered in the Czech Republic
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F06%3A00099021" target="_blank" >RIV/62156489:43210/06:00099021 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Molecular markers of genetic variability in triticale varieties registered in the Czech Republic
Original language description
Genetic variability was detected in 15 varieties of triticale (XTriticosecale Wittmack., 2n = 6x = 42, BBAARR) registered in the Czech Republic by means of polymorphism of DNA using the RAPD method and the SSR method. For detection we used 80 RAPD primers. The lower reproducibility of the RAPD markers was resolved by means of repeated analyses (3--4 times). On the basis of statistical evaluation a dendrogram was set up, which allows highly significantly to differentiate the varieties Kolor, Modus and Tornado. The remaining 12 analysed varieties formed 4 clusters. In addition to the RAPD markers a protocol of detection of DNA polymorphism was elaborated and optimised with microsatellite (SSR) markers. For the analyses we used 2 SSR markers (1A chromosome [Xpsp2999] and 1B chromosome [Xpsp3000]), which have been discovered in wheat (T. aestivum L.). Basing on these two SSR markers the only variety Triamant was distinguished from the clusters of the other analysed varieties.
Czech name
Molekulární markery genetické variability u odrůd tritikale registrovaných v České republice
Czech description
Genetická variabilita byla detekována metodami molekulární genetiky (RAPD a SSR) u 15 odrůd tritikale (XTriticosecale Wittmack., 2n = 6x = 42, BBAARR), které jsou registrovány v České republice. Pro detekci polymorfizmu DNA bylo využito 80 RAPD primerů.Nižší reprodukovatelnost RAPD analýz byla kompenzována opakováním analýz (3--4x). Na základě statistického vyhodnocení byl sestaven dendrogram, kde je možno vysoce průkazně odlišit odrůdy Kolor, Modus a Tornado. Zbývajících 12 analyzovaných odrůd tvoří čtyři klastery. Byl optimalizován protokol detekce variability DNA pomocí mikrosatelitních markerů u tritikale. Pro analýzy byly využity dva SSR markery (1A chromozom [Xpsp2999] a 1B chromozom [Xpsp3000]), které byly popsány u pšenice obecné (T. aestivumL.). Na základě použitých dvou SSR markerů se podařilo odlišit odrůdu Triamant od klasterů ostatních analyzovaných odrůd.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GP521%2F03%2FP173" target="_blank" >GP521/03/P173: Using biochemical and molecular markers to study the genetic diversity of triticale (XTriticosecale Wittmack)</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis
ISSN
1211-8516
e-ISSN
—
Volume of the periodical
LIV
Issue of the periodical within the volume
5
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
6
Pages from-to
149-154
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—