Determination of candidates sequence biosynthetic pathway for anthocyanins in wheat

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F12%3A00190590" target="_blank" >RIV/62156489:43210/12:00190590 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/25328859:_____/12:#0000705

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Stanovení kandidátní sekvence biosyntetické dráhy anthokyanů u pšenice

Original language description

Anthokyany jsou rostlinné pigmenty, které patří do skupiny flavonoidů. U pšenice (Triticum aestivum L.) se spolupodílejí na rozdílném zbarvení obilky. V této práci jsme se zabývali geny z rané a pozdní biosyntetické dráhy anthokyanů, chalkon izomerázou (CHI) a dihydroflavonol reduktázou (DFR). Jako materiál byly použity zrající obilky jarní formy pšenice s různým zabarvením aleuronu a obalových vrstev. Z obilek byla vyizolována celková RNA a přepsána do cDNA. Při návrhu primerů byly použity sekvence cDNA pro CHI a pro DFR, získané z databáze NCBI. PCR reakcí byly amplifikovány úseky sekvencí pro CHI a DFR, které byly po purifikaci použity pro přímé sekvenování PCR produktu. Získané kandidátní sekvence byly pro vyhodnocení polymorfizmu porovnány se sekvencemi přístupnými v databázi NCBI.

Czech name

Stanovení kandidátní sekvence biosyntetické dráhy anthokyanů u pšenice

Czech description

Anthokyany jsou rostlinné pigmenty, které patří do skupiny flavonoidů. U pšenice (Triticum aestivum L.) se spolupodílejí na rozdílném zbarvení obilky. V této práci jsme se zabývali geny z rané a pozdní biosyntetické dráhy anthokyanů, chalkon izomerázou (CHI) a dihydroflavonol reduktázou (DFR). Jako materiál byly použity zrající obilky jarní formy pšenice s různým zabarvením aleuronu a obalových vrstev. Z obilek byla vyizolována celková RNA a přepsána do cDNA. Při návrhu primerů byly použity sekvence cDNA pro CHI a pro DFR, získané z databáze NCBI. PCR reakcí byly amplifikovány úseky sekvencí pro CHI a DFR, které byly po purifikaci použity pro přímé sekvenování PCR produktu. Získané kandidátní sekvence byly pro vyhodnocení polymorfizmu porovnány se sekvencemi přístupnými v databázi NCBI.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GD204%2F09%2FH002" target="_blank" >GD204/09/H002: Plant Developmental Biology and Genetics</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2012

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Volume of the periodical

—

Issue of the periodical within the volume

9

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

5

Pages from-to

183-187

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—