Sequence analysis of genes from wheat anthocyanin biosynthetic pathway

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F13%3A00209756" target="_blank" >RIV/62156489:43210/13:00209756 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Sekvenční analýza genů z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice

Original language description

Anthokyany, flavonoidní látky, jsou zodpovědné za rozdílné zbarvení obilek pšenice seté (Triticum aestivum L.). Pigmenty tvořené biosyntetickou drahou anthokyanů jsou ukládány v různých částech obilky. Purpurové pigmenty jsou akumulovány v perikarpu a modré pigmenty v aleuronové vrstvě obilky. V pokusech byly použity jarní formy pšenice, dva genotypy s purpurově zbarveným perikarpem a dva genotypy s modře zbarvenou aleuronovu vrstvou. Genotyp s bílou obilkou sloužil jako kontrola. Z vyvíjejících se obilek byla izolována celková RNA. Pomocí reverzní transkripce byla získána cDNA. Na základě sekvenace získaných DNA fragmentů byly detekovány kandidátní sekvence genů pro chalkonisomerasu (podobnost 98-100%), pro dihydroflavonolreduktasu (95-100% podobnost)a pro anthokyanidinsynthasu. Variabilita zjištěná mezi studovanými genotypy byla způsobena jednonukleotidovými polymorfismy a indely. Získané sekvence byly lokalizovány v genomu pšenice.

Czech name

Sekvenční analýza genů z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice

Czech description

Anthokyany, flavonoidní látky, jsou zodpovědné za rozdílné zbarvení obilek pšenice seté (Triticum aestivum L.). Pigmenty tvořené biosyntetickou drahou anthokyanů jsou ukládány v různých částech obilky. Purpurové pigmenty jsou akumulovány v perikarpu a modré pigmenty v aleuronové vrstvě obilky. V pokusech byly použity jarní formy pšenice, dva genotypy s purpurově zbarveným perikarpem a dva genotypy s modře zbarvenou aleuronovu vrstvou. Genotyp s bílou obilkou sloužil jako kontrola. Z vyvíjejících se obilek byla izolována celková RNA. Pomocí reverzní transkripce byla získána cDNA. Na základě sekvenace získaných DNA fragmentů byly detekovány kandidátní sekvence genů pro chalkonisomerasu (podobnost 98-100%), pro dihydroflavonolreduktasu (95-100% podobnost)a pro anthokyanidinsynthasu. Variabilita zjištěná mezi studovanými genotypy byla způsobena jednonukleotidovými polymorfismy a indely. Získané sekvence byly lokalizovány v genomu pšenice.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2013

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Volume of the periodical

2013

Issue of the periodical within the volume

12

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

5

Pages from-to

177-181

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—