Application for comparing the character and color of cereal endosperm
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F20%3A43918481" target="_blank" >RIV/62156489:43210/20:43918481 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.utad.cz/wp-content/uploads/2020/11/Volume.zip" target="_blank" >https://www.utad.cz/wp-content/uploads/2020/11/Volume.zip</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Aplikace pro srovnání charakteru a barvy endospermu obilovin
Original language description
Aplikace umožňuje barevné odlišení endospermu vybraného rodu zrnin na základě sestavených etalonů pro daný druh a odrůdu. Barevné rozlišení je provedeno na dvou úrovních - rozlišení barev ve větším počtu menších čtvercových ROI (region of interest) v základě podobnosti jednotlivých pixelů v RGB prostoru. Výběr ROI pro tvorbu etalonu a počtu i umístění ROI ve zkoumaném vzorku je prováděn v této variantě ručně. Zároveň však umožňuje zkoumání plochy řezu téměř celé obilky na základě barevných skóre, kdy je záměrně použit ROI tvaru úhlové výseče v mezikruží. V tomto režimu software automaticky detekuje polohu obilky v obraze, obsluha může (zejména u nesouměrných obilek) střed ROI modifikovat.
Czech name
Aplikace pro srovnání charakteru a barvy endospermu obilovin
Czech description
Aplikace umožňuje barevné odlišení endospermu vybraného rodu zrnin na základě sestavených etalonů pro daný druh a odrůdu. Barevné rozlišení je provedeno na dvou úrovních - rozlišení barev ve větším počtu menších čtvercových ROI (region of interest) v základě podobnosti jednotlivých pixelů v RGB prostoru. Výběr ROI pro tvorbu etalonu a počtu i umístění ROI ve zkoumaném vzorku je prováděn v této variantě ručně. Zároveň však umožňuje zkoumání plochy řezu téměř celé obilky na základě barevných skóre, kdy je záměrně použit ROI tvaru úhlové výseče v mezikruží. V tomto režimu software automaticky detekuje polohu obilky v obraze, obsluha může (zejména u nesouměrných obilek) střed ROI modifikovat.
Classification
Type
R - Software
CEP classification
—
OECD FORD branch
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
Srovnání obilek
Technical parameters
Aplikace je vytvořena jako terminálové řešení a distribuována v podobě instalačního balíčku pro PC s operačními systémem Windows (8.1 a vyšší). Pracuje s fotografiemi příčného řezu obilek (Cryo-Cut microtom - American Optical Corp.) z mikroskopu SZH10 (Olympus) ve formátu jpg. Využití vyžaduje proškolenou obsluhu mikroskopu i dané aplikace. Osobou odpovědnou pro jednání ze strany MENDELU je doc. Ing. Martin Fajman, Ph.D., Ústav techniky a automobilové dopravy, Agronomická fakulta, MENDELU, Zemědělská 1, 613 00 Brno, +420 545 133 327.
Economical parameters
Aplikace umožňuje na výzkumné bázi přesnou analýzu barevné škály endospermu obilek (původně rodu Triticum a odlišení tzv. žlutých odrůd s vysokým obsahem karotenoidů). Je však použitelná šířeji, pro odlišení sklovitého a škrobovitého endospermu, popř. jiných barevných variant endospermu. Distribuována je plnohodnotná verze softwaru.
Owner IČO
62156489
Owner name
Mendelova univerzita v Brně