Distribution and characterization of qinolone resistance in Aeromonas isolates from Czech fish farms

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F18%3A43877049" target="_blank" >RIV/62157124:16270/18:43877049 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Rozšíření a charakteristika chinolonové rezistence u izolátů aeromonad z českých chovů ryb

Original language description

Intenzivní chov ryb je vystaven zvýšenému riziku výskytu infekčních nemocí. Aeromonády patří ke skupině bakterií, která je běžnou součástí vodních ekosystémů, a vedle řady nepatogenních druhů zahrnuje také druhy, které jsou pro ryby patogenní nebo oportunně patogenní. Předmětem této studie bylo u kolekce 327 izolátů Aeromonas spp. z kapra obecného a 73 izolátů Aeromonas salmonicida z pstruha duhového a sivena amerického, získaných během let 2010-2016, zjistit stav rezistence vůči chinolonovým antimikrobikům. U izolátů se sníženou citlivostí vůči ciprofloxacinu (? 0,05 ?g/ml) byla sledována rezistence kódovaná na plazmidech (PMQR - plasmid-mediated quinolone resistence). Chromozomálně vázané mechanismy této rezistence nebyly sledovány. Sníženou citlivost k fluorochinolonům vykazovalo celkem 257 (64 %, n=400) izolátů, z nich 212 (65 %, n=327) pocházelo z kaprovitých ryb a 45 z lososovitých ryb (62 %, n=73). U těchto izolátů byla provedena detekce genů PMQR metodou PCR a sekvenování, což odhalilo přítomnost genu qnrS2 u 36 izolátů. V případě kaprovitých ryb byl tento gen prokázán u 11 izolátů (5 %, n=212), zatímco v souboru z lososovitých bylo zastoupení výrazně vyšší, přičemž bylo získáno 25 izolátů aeromonád (56 %, n=45) s genem qnrS2. Všechny pozitivní izoláty z lososovitých ryb byly identifikovány jako Aeromonas salmonicida, zatímco izoláty z kaprovitých ryb jako Aeromonas veronii. Restrikční analýza genomové DNA ukázala na vysokou diverzitu izolátů A. veronii, které náležely k 6 různým profilům. Izoláty A. salmonicida vykazovaly pouze 3 odlišné restrikční profily. Celkem 33 (92 %, n=36) testovaných izolátů s qnrS2 neslo plazmid skupiny inkompatibility U.

Czech name

Rozšíření a charakteristika chinolonové rezistence u izolátů aeromonad z českých chovů ryb

Czech description

Intenzivní chov ryb je vystaven zvýšenému riziku výskytu infekčních nemocí. Aeromonády patří ke skupině bakterií, která je běžnou součástí vodních ekosystémů, a vedle řady nepatogenních druhů zahrnuje také druhy, které jsou pro ryby patogenní nebo oportunně patogenní. Předmětem této studie bylo u kolekce 327 izolátů Aeromonas spp. z kapra obecného a 73 izolátů Aeromonas salmonicida z pstruha duhového a sivena amerického, získaných během let 2010-2016, zjistit stav rezistence vůči chinolonovým antimikrobikům. U izolátů se sníženou citlivostí vůči ciprofloxacinu (? 0,05 ?g/ml) byla sledována rezistence kódovaná na plazmidech (PMQR - plasmid-mediated quinolone resistence). Chromozomálně vázané mechanismy této rezistence nebyly sledovány. Sníženou citlivost k fluorochinolonům vykazovalo celkem 257 (64 %, n=400) izolátů, z nich 212 (65 %, n=327) pocházelo z kaprovitých ryb a 45 z lososovitých ryb (62 %, n=73). U těchto izolátů byla provedena detekce genů PMQR metodou PCR a sekvenování, což odhalilo přítomnost genu qnrS2 u 36 izolátů. V případě kaprovitých ryb byl tento gen prokázán u 11 izolátů (5 %, n=212), zatímco v souboru z lososovitých bylo zastoupení výrazně vyšší, přičemž bylo získáno 25 izolátů aeromonád (56 %, n=45) s genem qnrS2. Všechny pozitivní izoláty z lososovitých ryb byly identifikovány jako Aeromonas salmonicida, zatímco izoláty z kaprovitých ryb jako Aeromonas veronii. Restrikční analýza genomové DNA ukázala na vysokou diverzitu izolátů A. veronii, které náležely k 6 různým profilům. Izoláty A. salmonicida vykazovaly pouze 3 odlišné restrikční profily. Celkem 33 (92 %, n=36) testovaných izolátů s qnrS2 neslo plazmid skupiny inkompatibility U.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

—

OECD FORD branch

40301 - Veterinary science

Project

<a href="/en/project/QK1710114" target="_blank" >QK1710114: New viral diseases of common carp - diagnosis and prevention</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2018

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Ochrana zdraví ryb 2018

ISBN

978-80-7514-068-5

ISSN

—

e-ISSN

neuvedeno

Number of pages

4

Pages from-to

33-36

Publisher name

Jihočeská univerzita v Č. Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod

Place of publication

České Budějovice

Event location

Vodňany

Event date

Mar 26, 2018

Type of event by nationality

CST - Celostátní akce

UT code for WoS article

—