Technological process for preparation of colorectal cancer samples for Next generation sequencing
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F63078180%3A_____%2F17%3AN0000003" target="_blank" >RIV/63078180:_____/17:N0000003 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.vuab.cz" target="_blank" >http://www.vuab.cz</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Ověřený technologický postup přípravy vzorků nádoru kolorekta pro NGS zařízení
Original language description
Ověřená technologie popisuje postup přípravy knihovny vzorků vhodné kvality pro sekvenování nové generace (NGS) na přístoji Illumina MiSeq ze vzorků nádorové tkáně v parafínovém bločku (FFPE). Tento postup zahrnuje definici parametrů pro vstupní vzorek, jeho zpracování vhodnou izolační metodou. Definuje postupy pro kontrolu kvality vstupní DNA, popisuje způsob amplifikace, ředění a teplotního profilu PCR pro získání dostatečně kvalitní a koncentrované knihovny vzorků. Dále technologie popisuje způsob inkorporace indexů a adaptorů a podmínky purifikace vedoucí k získání konečné knihovny DNA pro aplikaci do přístroje MiSeq.
Czech name
Ověřený technologický postup přípravy vzorků nádoru kolorekta pro NGS zařízení
Czech description
Ověřená technologie popisuje postup přípravy knihovny vzorků vhodné kvality pro sekvenování nové generace (NGS) na přístoji Illumina MiSeq ze vzorků nádorové tkáně v parafínovém bločku (FFPE). Tento postup zahrnuje definici parametrů pro vstupní vzorek, jeho zpracování vhodnou izolační metodou. Definuje postupy pro kontrolu kvality vstupní DNA, popisuje způsob amplifikace, ředění a teplotního profilu PCR pro získání dostatečně kvalitní a koncentrované knihovny vzorků. Dále technologie popisuje způsob inkorporace indexů a adaptorů a podmínky purifikace vedoucí k získání konečné knihovny DNA pro aplikaci do přístroje MiSeq.
Classification
Type
Z<sub>tech</sub> - Verified technology
CEP classification
—
OECD FORD branch
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TA04010838" target="_blank" >TA04010838: Diagnostics of cancer with Next Generation Sequencing</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2017
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data specific for result type
Internal product ID
TA04010838V003
Numerical identification
2014TA04010838
Technical parameters
Technologický postup s definovanými kontrolními body a pro použití společně s diagnostickými kity pro NGS
Economical parameters
Ekonomické přínosy se předpokládají v souvislosti s prodejem výsledku Prototyp. VUAB Pharma a.s. plánuje výsledek využít k vývoji dalších kitů pro jiná onkologická onemocnění (melanom, detekce mikrosatelitní instability) ve spolupráci s klinickými a výzkumnými pracovišti v rámci dalších grantových či negrantových projektů.
Application category by cost
—
Owner IČO
63078180
Owner name
VUAB Pharma a.s.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
V - Výsledek je využíván vlastníkem
Licence fee requirement
—
Web page
www.vuab.cz