Access to high resolution histological images over the Internet

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F63839172%3A_____%2F07%3A00000690" target="_blank" >RIV/63839172:_____/07:00000690 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Access to high resolution histological images over the Internet

Original language description

High resolution images can be obtained by scanning the tissue and stitching individual parts of the images together (like tiles). This method overcomes the optical limitations and enables obtaining images of arbitrary size. We have developed the user's interface in the form of virtual microscope, enabling the access to very large images using the Internet browser. Our approach is based on JavaScript. The images is split into parts (256x256 px). Users can drag the image using the mouse and change the magnification. The browsers downloads only those parts of the image, which are necessary. Those image parts, which are no longer necessary, are released from memory. Users can change the size of the browser window (up to full screen), drag the image and change the magnification. Virtual slides can catch the whole slide (not only selected areas with typical features) and therefore can have certain forensic value. This interface is used in the Atlas of Dermatopathology, Atlas of Fetal and Neo

Czech name

Přístup k histologickým obrazům o vysokém rozlišení prostřednictvím Internetu

Czech description

Histologické preparáty mohou být snímány postupně a jednotlivé dílky obrazu lze spojit. Takto vzniká obraz histologického preparátu o předem zvoleném rozlišení, přičemž limitace dané mikroskopickou optikou (tedy zvětšení objektivu, numerická apertura a zorné pole) jsou tímto postupem překonány. Některé systémy navíc umožňují snímání s mezifokusem nebo snímání ve více fokusovacích rovinách. Pro přístup k takovýmto obrazům se používá rozhraní virtuálního mikroskopu. Obrazy mohou být uložené na lokálním disku nebo na jiném počítači, přístupném prostředníctvím lokální nebo veřejné sítě. Práce s takovými obrazy klade značné nároky na výpočetní prostředky (především paměť) a přenos obrazů zatěžuje síť. Vzhledem k objemu dat je nutné hledat způsob, jak takovéto datové objemy přenést a zobrazit. V našich atlasech máme obrazy o velkém rozlišení již téměř deset let. Zpočátku jsme obrazy snímali kamerou o vysokém rozlišení, později jsme přešli na obrazy získané skládáním. Zpočátku jsme používali

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

JC - Computer hardware and software

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1ET202090537" target="_blank" >1ET202090537: MediGrid - methods and tools for GRID application in biomedicine</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

15. sjezd českých a slovenských patologů

ISBN

978-80-7368-331-3

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

22-22

Publisher name

Ostravská univerzita v Ostravě

Place of publication

Ostrava

Event location

Rožnov pod Radhoštěm

Event date

Aug 29, 2007

Type of event by nationality

EUR - Evropská akce

UT code for WoS article

—