Prototype of the kit for quantification of the selected gene expression, PNPLA3
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F64578895%3A_____%2F20%3AN0000001" target="_blank" >RIV/64578895:_____/20:N0000001 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Prototyp soupravy pro kvantifikaci exprese vybraného genu, PNPLA3
Original language description
V rámci tohoto projektu byla vyvinuta nová zjednodušená metoda pro kvantifikaci exprese PNPLA3 genu. Metoda spočívá ve vazbě specifických DNA oligonukleotidových sond na templátovou RNA pro PNPLA3, ligaci DNA sond vázaných na PNPLA3 RNA pomocí DNA ligázy a následné aplifikaci ligovaných úseků DNA pomocí qPCR. Byly vyvinuty pufrované roztoky s aditivy, které umožňují provést hybridizaci, ligaci i qPCR v jedné zkumavce. Tato metoda byla využita pro přípravu prototypu soupravu na stanovení PNPLA3 mRNA. Souprava obsahuje všechny komponenty nutné pro kvantifikaci PNPLA3 z izolované RNA, včetně specifických oligonukleotidových primerů, ligaci a amplifikaci ligovaných fragmentů pomocí qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1.
Czech name
Prototyp soupravy pro kvantifikaci exprese vybraného genu, PNPLA3
Czech description
V rámci tohoto projektu byla vyvinuta nová zjednodušená metoda pro kvantifikaci exprese PNPLA3 genu. Metoda spočívá ve vazbě specifických DNA oligonukleotidových sond na templátovou RNA pro PNPLA3, ligaci DNA sond vázaných na PNPLA3 RNA pomocí DNA ligázy a následné aplifikaci ligovaných úseků DNA pomocí qPCR. Byly vyvinuty pufrované roztoky s aditivy, které umožňují provést hybridizaci, ligaci i qPCR v jedné zkumavce. Tato metoda byla využita pro přípravu prototypu soupravu na stanovení PNPLA3 mRNA. Souprava obsahuje všechny komponenty nutné pro kvantifikaci PNPLA3 z izolované RNA, včetně specifických oligonukleotidových primerů, ligaci a amplifikaci ligovaných fragmentů pomocí qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1.
Classification
Type
G<sub>prot</sub> - Prototype
CEP classification
—
OECD FORD branch
30101 - Human genetics
Result continuities
Project
<a href="/en/project/FV20479" target="_blank" >FV20479: Simplified method for quantification of specific genes expression</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
R-qPCR_PNPLA3_WT-SYBR
Numerical identification
—
Technical parameters
Jedná se o soupravu pro stanovení mRNA pro PNPLA3 WT: Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem, 3) DNA ligázu (SplintR) a 4) DNA sondy L a R. Jedná se o dva syntetické oligonukleotidy DNA, jejichž sekvence jsou komplementární ke stanovované mRNA a navazují bezprostředně na sebe. Sekvence každé sondy na jednom konci pokračuje sekvencí pro nasedání primerů pro qPCR detekci. Tyto amplifikační primery jsou rovněž součástí soupravy. Souprava bude vyráběna ve společnosti Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, které se podílelo na řešení projektu, případně bude po udělení podaného patentu, nabídnuta na licenčním základě zájemcům.
Economical parameters
Jedná se o stanovení unikátní PNPLA3 mRNA s využitím až stovek souprav ročně na domácím trhu se ziskem z domácího trhu v jednotkách stovek tisíc Kč.
Application category by cost
—
Owner IČO
64578895
Owner name
Top-Bio, s.r.o., Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence
Licence fee requirement
Z - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje v některých případech licenční poplatek
Web page
—