Prototype of a universally applicable kit for simplified quantification of gene expression using the intercalation dye SYBR
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F64578895%3A_____%2F20%3AN0000003" target="_blank" >RIV/64578895:_____/20:N0000003 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Prototyp univerzálně použitelné soupravy zjednodušené kvantifikace genové exprese s využitím interkalačního barviva SYBR
Original language description
V rámci tohoto projektu byla vyvinuta nová zjednodušená univerzální metoda pro kvantifikaci exprese genů. Metoda spočívá ve vazbě specifických DNA oligonukleotidových sond na templátovou RNA, ligaci DNA sond vázaných na mRNA pomocí DNA ligázy a následné aplifikaci ligovaných úseků DNA pomocí qPCR. Byly vyvinuty pufrované roztoky s aditivy, které umožňují provést hybridizaci, ligaci i qPCR v jedné zkumavce. Tato metoda byla využita pro přípravu prototypu univerzální soupravu mRNA. Souprava obsahuje všechny komponenty nutné pro kvantifikaci vybrané mRNA, včetně návodu na navržení specifických oligonukleotidových primerů, ligaci a amplifikaci ligovaných fragmentů pomocí qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1. Dvojice oligonukleotidových sond specifických prouživatelem zvolenou mRNA a amplifikační primery nejsou součástí soupravy.
Czech name
Prototyp univerzálně použitelné soupravy zjednodušené kvantifikace genové exprese s využitím interkalačního barviva SYBR
Czech description
V rámci tohoto projektu byla vyvinuta nová zjednodušená univerzální metoda pro kvantifikaci exprese genů. Metoda spočívá ve vazbě specifických DNA oligonukleotidových sond na templátovou RNA, ligaci DNA sond vázaných na mRNA pomocí DNA ligázy a následné aplifikaci ligovaných úseků DNA pomocí qPCR. Byly vyvinuty pufrované roztoky s aditivy, které umožňují provést hybridizaci, ligaci i qPCR v jedné zkumavce. Tato metoda byla využita pro přípravu prototypu univerzální soupravu mRNA. Souprava obsahuje všechny komponenty nutné pro kvantifikaci vybrané mRNA, včetně návodu na navržení specifických oligonukleotidových primerů, ligaci a amplifikaci ligovaných fragmentů pomocí qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1. Dvojice oligonukleotidových sond specifických prouživatelem zvolenou mRNA a amplifikační primery nejsou součástí soupravy.
Classification
Type
G<sub>prot</sub> - Prototype
CEP classification
—
OECD FORD branch
30101 - Human genetics
Result continuities
Project
<a href="/en/project/FV20479" target="_blank" >FV20479: Simplified method for quantification of specific genes expression</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
R-qPCR-UNIVERSAL SYBR
Numerical identification
—
Technical parameters
Jedná se o univerzální soupravu R-qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1. Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R- qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem a 3) DNA ligázu (SplintR). Souprava neobsahuje DNA sondy, ale obsahuje návod na navržení optimálních DNA sond. Soupravu bude vyrábět Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, která se podílela na řešení projektu.
Economical parameters
Univerzálních R-qPCR souprav s využitím SYBR Green 1 se může ročně prodat až několik tisíc kusů ročně se ziskem z domácího trhu v jednotkách jednotek miliónů Kč.
Application category by cost
—
Owner IČO
64578895
Owner name
Top-Bio, s.r.o., Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence
Licence fee requirement
Z - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje v některých případech licenční poplatek
Web page
—