Neuromuscular diseases - methods of molecular genetic diagnostics and results of their application

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F19%3A00071695" target="_blank" >RIV/65269705:_____/19:00071695 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://aleph.nkp.cz/F/?func=direct&doc_number=003124000&local_base=NKC" target="_blank" >https://aleph.nkp.cz/F/?func=direct&doc_number=003124000&local_base=NKC</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Neuromuskulární onemocnění – metody molekulárně genetické diagnostiky a výsledky jejich aplikace

Original language description

Neuromuskulární onemocnění (NMD) se vyznačují velkou klinickou a genetickou heterogenitou. Dle www.musclegenetable.fr v současné době rozeznáváme 16 skupin NMD, které zahrnují 955 různých typů neuromuskulárních onemocnění a 535 genů. Vzhledem k tomu, že patogenní varianty v jednotlivých genech asociovaných s NMD mohou být různého typu (bodové, rozsáhlé delece/duplikace/inzerce, expanze mikrosatelitních repetitivních sekvencí, delece makrosatelitních repetitivních sekvencí) je třeba v oblasti molekulárně genetické diagnostiky aplikovat různé metodické přístupy - od přímé sekvenční analýzy, fragmentační analýzy přes Southern blot a hybridizaci až po techniky sekvenování nové generace (NGS). Prezentujeme výsledky molekulárně genetické diagnostiky NMD se zaměřením na svalové dystrofie, myopatie a myastenické syndromy. Obecně je uváděno, že svalové dystrofie jsou asociovány s geny kódujícími proteiny plazmatické membrány, sarkomery, extracelulární matrix nebo jaderné membrány a známkami dystrofického procesu ve svalové tkáni; myopatie s geny kódujícími proteiny uplatňujícími se při kontrakci svalu a ve svalové tkáni jsou patrny ultrastrukturní změny. Spolehlivé rozlišení svalových dystrofií a myopatií ale neexistuje, tyto dvě skupiny onemocnění se překrývají na klinické, patologické i genetické úrovni a patogenní varianty v určitých genech mohou způsobovat NMD patřící jak do skupiny svalových dystrofií tak myopatií. Kongenitální myastenické syndromy (CMS) jsou spojeny s geny, jejichž proteinové produkty hrají roli v přenosu vzruchu na spojení nervu a svalu. Molekulárně genetická diagnostika NMD představuje komplexní problém, který se díky novým metodickým přístupům daří řešit a dospět tak k výsledku v podobě nalezení molekulární příčiny onemocnění pacienta. Svalové dystrofie, myopatie a kongenitální myastenické syndromy zahrnují v současné době 157 asociovaných genů. Molekulárně genetická diagnostika metodami NGS jak na úrovni panelu, tak na úrovni exomu odhaluje množství sekvenčních variant, které je nutno pečlivě interpretovat jak v souvislosti s dalšími nálezy pacienta, tak v souvislosti s dostupnými literárními údaji a analýzami in silico.

Czech name

Neuromuskulární onemocnění – metody molekulárně genetické diagnostiky a výsledky jejich aplikace

Czech description

Neuromuskulární onemocnění (NMD) se vyznačují velkou klinickou a genetickou heterogenitou. Dle www.musclegenetable.fr v současné době rozeznáváme 16 skupin NMD, které zahrnují 955 různých typů neuromuskulárních onemocnění a 535 genů. Vzhledem k tomu, že patogenní varianty v jednotlivých genech asociovaných s NMD mohou být různého typu (bodové, rozsáhlé delece/duplikace/inzerce, expanze mikrosatelitních repetitivních sekvencí, delece makrosatelitních repetitivních sekvencí) je třeba v oblasti molekulárně genetické diagnostiky aplikovat různé metodické přístupy - od přímé sekvenční analýzy, fragmentační analýzy přes Southern blot a hybridizaci až po techniky sekvenování nové generace (NGS). Prezentujeme výsledky molekulárně genetické diagnostiky NMD se zaměřením na svalové dystrofie, myopatie a myastenické syndromy. Obecně je uváděno, že svalové dystrofie jsou asociovány s geny kódujícími proteiny plazmatické membrány, sarkomery, extracelulární matrix nebo jaderné membrány a známkami dystrofického procesu ve svalové tkáni; myopatie s geny kódujícími proteiny uplatňujícími se při kontrakci svalu a ve svalové tkáni jsou patrny ultrastrukturní změny. Spolehlivé rozlišení svalových dystrofií a myopatií ale neexistuje, tyto dvě skupiny onemocnění se překrývají na klinické, patologické i genetické úrovni a patogenní varianty v určitých genech mohou způsobovat NMD patřící jak do skupiny svalových dystrofií tak myopatií. Kongenitální myastenické syndromy (CMS) jsou spojeny s geny, jejichž proteinové produkty hrají roli v přenosu vzruchu na spojení nervu a svalu. Molekulárně genetická diagnostika NMD představuje komplexní problém, který se díky novým metodickým přístupům daří řešit a dospět tak k výsledku v podobě nalezení molekulární příčiny onemocnění pacienta. Svalové dystrofie, myopatie a kongenitální myastenické syndromy zahrnují v současné době 157 asociovaných genů. Molekulárně genetická diagnostika metodami NGS jak na úrovni panelu, tak na úrovni exomu odhaluje množství sekvenčních variant, které je nutno pečlivě interpretovat jak v souvislosti s dalšími nálezy pacienta, tak v souvislosti s dostupnými literárními údaji a analýzami in silico.

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

10606 - Microbiology

Project

<a href="/en/project/TE02000058" target="_blank" >TE02000058: Center of competence for molecular diagnostics and personalized medicine</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2019

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů