8Q24 duplication in chronic lymphocytic leukemia: cytogenetic and molecular-biological analysis of MYC gene aberrations
Result description
Objectives: Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is a disease characterized by a high degree of diversity in both clinical manifestations and cytogenomic findings of patients. Cytogenetic findings of TP53 and ATM deletion, or a highly complex karyotype (GREATER-THAN OR EQUAL TO5 cytogenetic changes) are associated with poor prognosis. Within the complex karyotype (KK), aberrations occur, which contribute to the aggressiveness of the disease to varying degrees. One of these candidate aberrations is the acquisition of the q-arm portion of chromosome 8 (+ 8q), which includes the MYC gene. We focused on a detailed cytogenetic analysis of complex karyotypes with this aberration, on the determination of the fracture site and the minimum duplicated region 8q, on the analysis of MYC expression and on the relationship to the survival of patients. Methods: A panel of FISH probes (ATM, TP53, CEP12, 13q, 8q24) was used to examine CLL patients and a karyotype based on G-banding was constructed. In patients with KK / delATM and / or delTP53 together with + 8q, the karyotype was analyzed in more detail by m-FISH and m-BAND. MYC mRNA level was determined by qRT-PCR, protein level by western blot.
Keywords
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
Result on the web
https://www.prolekare.cz/casopisy/transfuze-hematologie-dnes/archiv-cisel/2021-supplementum-2
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Duplikace 8Q24 v chronické lymfocytární leukémii: cytogenetická a molekulárně-biologická analýza aberací genu MYC
Original language description
Cíle: Chronická lymfocytární leukemie (CLL) je onemocnění charakterizované vysokou mírou diverzity jak klinických projevů, tak cytogenomických nálezů pacientů. Se špatnou prognózou jsou spojeny cytogenetické nálezy delece TP53 a ATM, nebo vysoce komplexní karyotyp (GREATER-THAN OR EQUAL TO5 cytogenetických změn). V rámci komplexního karyotypu (KK) se vyskytují aberace, které k agresivitě onemocnění přispívají různou mírou. Jednou z těchto kandidátních aberací je zisk části q-ramene chromosomu 8 (+8q), zahrnující gen MYC. Zaměřili jsme se na detailní cytogenetickou analýzu komplexních karyotypů s touto aberací, na určení místa zlomů a minimální duplikované oblasti 8q, na analýzu exprese MYC a na vztah k délce přežití pacientů. Metody: K vyšetření CLL pacientů byl použit panel FISH sond (ATM, TP53, CEP12, 13q, 8q24) a byl sestaven karyotyp na základě G-pruhování. U pacientů s KK/delATM a/nebo delTP53 společně s +8q byl karyotyp detailněji analyzován metodou m-FISH a m-BAND. Hladina mRNA MYC byla stanovena metodou qRT-PCR, hladina proteinu metodou western blot. Výsledky: Na základě skríningu pacientů metodami FISH a karyotypování jsme zjistili, že oblast 8q je častěji zmnožena u pacientů s KK/delATM a/nebo delTP53 (26,7 %) oproti neselektovaným CLL pacientům (6,3 %). Minimální duplikovaná oblast byla určena jako 8q23-8qter, v rámci KK byla duplikovaná oblast u různých pacientů translokována na různé chromozomy. Zjistili jsme mírné zvýšení hladiny mRNA a proteinu MYC u pacientů s +8q, a zkrácení celkového přežití u pacientů s +8q, ale tyto výsledky nedosáhly statistické významnosti. Závěr: Zmnožení části ramene 8q (minimální duplikovaná oblast 8q23-8qter) je častěji spojeno s KK a s delecí ATM a/nebo TP53, mírným zvýšením hladin mRNA a proteinu MYC, a mírným zkrácením celkové doby přežití. Jednoznačnější závěry by mohlo přinést rozšíření studovaného souboru.
Czech name
Duplikace 8Q24 v chronické lymfocytární leukémii: cytogenetická a molekulárně-biologická analýza aberací genu MYC
Czech description
Cíle: Chronická lymfocytární leukemie (CLL) je onemocnění charakterizované vysokou mírou diverzity jak klinických projevů, tak cytogenomických nálezů pacientů. Se špatnou prognózou jsou spojeny cytogenetické nálezy delece TP53 a ATM, nebo vysoce komplexní karyotyp (GREATER-THAN OR EQUAL TO5 cytogenetických změn). V rámci komplexního karyotypu (KK) se vyskytují aberace, které k agresivitě onemocnění přispívají různou mírou. Jednou z těchto kandidátních aberací je zisk části q-ramene chromosomu 8 (+8q), zahrnující gen MYC. Zaměřili jsme se na detailní cytogenetickou analýzu komplexních karyotypů s touto aberací, na určení místa zlomů a minimální duplikované oblasti 8q, na analýzu exprese MYC a na vztah k délce přežití pacientů. Metody: K vyšetření CLL pacientů byl použit panel FISH sond (ATM, TP53, CEP12, 13q, 8q24) a byl sestaven karyotyp na základě G-pruhování. U pacientů s KK/delATM a/nebo delTP53 společně s +8q byl karyotyp detailněji analyzován metodou m-FISH a m-BAND. Hladina mRNA MYC byla stanovena metodou qRT-PCR, hladina proteinu metodou western blot. Výsledky: Na základě skríningu pacientů metodami FISH a karyotypování jsme zjistili, že oblast 8q je častěji zmnožena u pacientů s KK/delATM a/nebo delTP53 (26,7 %) oproti neselektovaným CLL pacientům (6,3 %). Minimální duplikovaná oblast byla určena jako 8q23-8qter, v rámci KK byla duplikovaná oblast u různých pacientů translokována na různé chromozomy. Zjistili jsme mírné zvýšení hladiny mRNA a proteinu MYC u pacientů s +8q, a zkrácení celkového přežití u pacientů s +8q, ale tyto výsledky nedosáhly statistické významnosti. Závěr: Zmnožení části ramene 8q (minimální duplikovaná oblast 8q23-8qter) je častěji spojeno s KK a s delecí ATM a/nebo TP53, mírným zvýšením hladin mRNA a proteinu MYC, a mírným zkrácením celkové doby přežití. Jednoznačnější závěry by mohlo přinést rozšíření studovaného souboru.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
30204 - Oncology
Result continuities
Project
NU21-08-00237: Advanced sequencing methods for deciphering structural variants in cancer genome
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2021
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Basic information
Result type
O - Miscellaneous
OECD FORD
Oncology
Year of implementation
2021