Deregulation of the expression of long non-coding RNA molecules in plasma cell leukemia

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F21%3A00075539" target="_blank" >RIV/65269705:_____/21:00075539 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://www.prolekare.cz/casopisy/transfuze-hematologie-dnes/archiv-cisel/2021-supplementum-2" target="_blank" >https://www.prolekare.cz/casopisy/transfuze-hematologie-dnes/archiv-cisel/2021-supplementum-2</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Deregulace exprese dlouhých nekódujících molekul RNA u plazmocelulární leukemie

Original language description

Úvod: Mnohočetný myelom (MM) je druhé nejčastější hemato-onkologické onemocnění starších lidí charakterizované infiltrací kostní dřeně maligními plazmatickými buňkami. V ojedinělých případech může dojít k migraci těchto buněk do periferní krve a ztrátě jejich závislosti na mikroprostředí kostní dřeně. Tyto klonální buňky migrují do periferní krve a dávají vznik plasmocelulární leukemii (PCL). Cíl: Cílem této práce bylo analyzovat dysregulaci exprese dlouhých nekódujících molekul RNA (lncRNA) u pacientů s MM vs PCL a objasnit jejich zapojení do progrese MM do PCL. Metody: LncRNA byly izolovány z CD138+ buněk separovaných z kostní dřeně 11 PCL a 6 MM pacientů a bylo provedeno sekvenování nové generace (NGS) a qRT-PCR pro validaci. V explorativní fázi byla využita metoda NGS - ribosomální RNA byla depletována pomocí Ribo-Zero-Gold rRNA Removal Kit (Illumina, USA). Knihovny cDNA byly připraveny pomocí NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit a NEBNext Multiplex Oligos (Illumina, USA). Knihovny byly sekvenovány na NextSeq 500 Sequencing System pomocí NextSeq 500/550 High Output Kit v.2 (Ilumina, USA). Výsledky: Bylo nalezeno celkem 58 dysregulovaných molekul lncRNA. Ve validační fázi byla ověřena deregulace 4 lncRNA na nezávislém souboru 28 MM a 12 PCL. U dvou lncRNA molekul se potvrdila jejich statistická významnost. Závěr: Tato studie prokázala, že existují rozdílně exprimované lncRNA, které mohou být zapojeny do patogeneze PCL.

Czech name

Deregulace exprese dlouhých nekódujících molekul RNA u plazmocelulární leukemie

Czech description

Úvod: Mnohočetný myelom (MM) je druhé nejčastější hemato-onkologické onemocnění starších lidí charakterizované infiltrací kostní dřeně maligními plazmatickými buňkami. V ojedinělých případech může dojít k migraci těchto buněk do periferní krve a ztrátě jejich závislosti na mikroprostředí kostní dřeně. Tyto klonální buňky migrují do periferní krve a dávají vznik plasmocelulární leukemii (PCL). Cíl: Cílem této práce bylo analyzovat dysregulaci exprese dlouhých nekódujících molekul RNA (lncRNA) u pacientů s MM vs PCL a objasnit jejich zapojení do progrese MM do PCL. Metody: LncRNA byly izolovány z CD138+ buněk separovaných z kostní dřeně 11 PCL a 6 MM pacientů a bylo provedeno sekvenování nové generace (NGS) a qRT-PCR pro validaci. V explorativní fázi byla využita metoda NGS - ribosomální RNA byla depletována pomocí Ribo-Zero-Gold rRNA Removal Kit (Illumina, USA). Knihovny cDNA byly připraveny pomocí NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit a NEBNext Multiplex Oligos (Illumina, USA). Knihovny byly sekvenovány na NextSeq 500 Sequencing System pomocí NextSeq 500/550 High Output Kit v.2 (Ilumina, USA). Výsledky: Bylo nalezeno celkem 58 dysregulovaných molekul lncRNA. Ve validační fázi byla ověřena deregulace 4 lncRNA na nezávislém souboru 28 MM a 12 PCL. U dvou lncRNA molekul se potvrdila jejich statistická významnost. Závěr: Tato studie prokázala, že existují rozdílně exprimované lncRNA, které mohou být zapojeny do patogeneze PCL.

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

30205 - Hematology

Project

<a href="/en/project/NV18-03-00203" target="_blank" >NV18-03-00203: Liquid biopsies in plasma cell leukemia</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2021

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů