Extraction of extracellular vesicle proteins for proteomic analyzes
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985904%3A_____%2F20%3A00524422" target="_blank" >RIV/67985904:_____/20:00524422 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Extrakce proteinů extracelulárních váčků pro proteomické analýzy
Original language description
V této ověřené technologii zaměřené na extrakci proteinů extracelulárních váčků pro proteomické analýzy je popsán nový a optimalizovaný protokol pro přípravu vzorků pro analýzy pomocí hmotnostní spektrometrie (MS). Technologie zahrnuje postup lyzace extracelulárních váčků a extrakce proteinů, odstranění detergentů a jiných látek, které by mohly interferovat s analýzou MS, redukci a alkylaci proteinů a následné enzymatické štěpení proteinů na peptidy. Uvedená technologie poskytuje při srovnání s jinými testovanými detergenty největší výtěžek proteinů při lyzaci extracelulárních váčků a největší výtěžnost peptidů po enzymatickém štěpení. S tím souvisí také vysoký počet identifikovaných peptidů a proteinů v rámci LC-MS/MS analýz. Předností této technologie je rovněž její vysoká reprodukovatelnost a robustnost. Ověřená technologie je výsledkem projektu MŠMT LO1609 „Modely závažných lidských onemocnění: Traumatické poškození míchy, Huntingtonova choroba, melanom a neplodnost“.
Czech name
Extrakce proteinů extracelulárních váčků pro proteomické analýzy
Czech description
V této ověřené technologii zaměřené na extrakci proteinů extracelulárních váčků pro proteomické analýzy je popsán nový a optimalizovaný protokol pro přípravu vzorků pro analýzy pomocí hmotnostní spektrometrie (MS). Technologie zahrnuje postup lyzace extracelulárních váčků a extrakce proteinů, odstranění detergentů a jiných látek, které by mohly interferovat s analýzou MS, redukci a alkylaci proteinů a následné enzymatické štěpení proteinů na peptidy. Uvedená technologie poskytuje při srovnání s jinými testovanými detergenty největší výtěžek proteinů při lyzaci extracelulárních váčků a největší výtěžnost peptidů po enzymatickém štěpení. S tím souvisí také vysoký počet identifikovaných peptidů a proteinů v rámci LC-MS/MS analýz. Předností této technologie je rovněž její vysoká reprodukovatelnost a robustnost. Ověřená technologie je výsledkem projektu MŠMT LO1609 „Modely závažných lidských onemocnění: Traumatické poškození míchy, Huntingtonova choroba, melanom a neplodnost“.
Classification
Type
Z<sub>tech</sub> - Verified technology
CEP classification
—
OECD FORD branch
10609 - Biochemical research methods
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LO1609" target="_blank" >LO1609: Models of the Serious Human Diseases: Traumatic Spinal Cord Injury, Huntington’s Disease, Melanoma and Infertility</a><br>
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
Extrakce proteinů
Numerical identification
—
Technical parameters
Předložená technologie „Extrakce proteinů extracelulárních váčků pro proteomické analýzy“ poskytuje spolehlivé a reprodukovatelné výsledky hmotnostně spektrometrických analýz proteinového složení extracelulárních váčků. Tato technologie poskytuje větší množství identifikovaných proteinů extracelulárních váčků než dosud používané technologie.
Economical parameters
Aktuální roční ekonomický přínos pro pracoviště autora se pohybuje v řádu jednotek stovek tisíc na ušetření za komerčně dostupné technologie s podobnou, ačkoliv nižší výtěžností. Samotné využití technologie navíc umožňuje realizovat vědeckovýzkumné projekty financované mimo jiné z komerčních zdrojů v hodnotách jednotek milionů ročně. Celkový přínos je stejný nebo nižší než 5 milionů Kč za rok.
Application category by cost
—
Owner IČO
67985904
Owner name
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)
Licence fee requirement
—
Web page
—