Incongruent plastid and nuclear DNA phylogenies reveal ancient intergeneric hybridization in Pilosella hawkweeds (Hieracium, Cichorieae, Asteraceae)
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985939%3A_____%2F07%3A00089633" target="_blank" >RIV/67985939:_____/07:00089633 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/67985939:_____/07:00341891
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Incongruent plastid and nuclear DNA phylogenies reveal ancient intergeneric hybridization in Pilosella hawkweeds (Hieracium, Cichorieae, Asteraceae)
Original language description
Phylogenetic relationships for Hieracium subgen. Pilosella were inferred from chloroplast (trnT?trnL, matK) and nuclear (ITS) sequence data. Chloroplast markers revealed the existence of two divergent haplotype groups within the subgenus that did not correspond to presumed relationships. Chloroplast haplotypes of Hispidella and Andryala nested within these two groups. ITS data were in accord with morphology and reflected the true phylogeny. They revealed a sister relationship between Pilosella and Hispidella and a joint clade of Hieracium and Chionoracium while Andryala represented a third lineage. Detailed analysisof trnT?trnL character state evolution along the ITS tree suggested two intergeneric hybridization events between ancestral lineages that resulted in cytoplasmic transfer. These chloroplast capture events, the first of which involved a now extinct haplotype, are the most likely explanation for the incongruencies between plastid and nuclear DNA markers.
Czech name
Rozdíly mezi rekonstrukcí fylogenetikých vztahů na základě plastidové a jaderné DNA je možné vysvětlit dřívější mezirodovou hybridizací v Hieracium subgen. Pilosella (Hieracium, Cichorieae, Asteraceae)
Czech description
Byly rekonstruovány fylogenetické vztahy v rámci Hieracium subgen. Pilosella na základě sekvenování vybraných úseků cpDNA (trnT?trnL, matK) a jaderné DNA (ITS). Na základě cpDNA byly rozlišeny 2 skupiny haplotypů, které nekorespondují s doposud známou klasifikací. Chloroplastové haplotypy rodů Hispidella a Andryala spadají do těchto dvou skupin. ITS data jsou ve shodě s morfologií a zřejmě odrážejí skutečnou evoluci. Ukazují sesterský vztah mezi Hieracium subgen. Pilosella a Hispidella a společný klastrHieracium subgen. Hieracium a Hieracium subgen. Chionoracium; rod Andryala představuje třetí linii. Podrobná analýza evoluce trnT?trnL sekvencí ve spojení s fylogenetickou rekonstrukcí na základě ITS ukazuje na dvě mezirodová křížení mezi ancestrálnímiliniemi, která měla za následek cytoplasmatický transfer. Tyto chloroplast captures, z nichž první zahrnovala dnes zaniklý haplotyp, jsou nejpravděpodobnějším vysvětlením rozporu mezi plastidovýni a jadernými DNA markery.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EF - Botany
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/SE%2F610%2F3%2F00" target="_blank" >SE/610/3/00: Complex analyses of long term changes of the Giant Mountains tundra</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Molecular Phylogenetics and Evolution
ISSN
1055-7903
e-ISSN
—
Volume of the periodical
42
Issue of the periodical within the volume
-
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
15
Pages from-to
347-361
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—