Preferential elimination of repeated DNA sequences from the paternal, Nicotiana tomentosiformis genome donor of a synthetic, allotetraploid tobacco

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F05%3A00001178" target="_blank" >RIV/68081707:_____/05:00001178 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Preferential elimination of repeated DNA sequences from the paternal, Nicotiana tomentosiformis genome donor of a synthetic, allotetraploid tobacco

Original language description

In this paper we have studied repetitive sequences in the synthetic tobacco genome. While the most repeats were faithfully inherited from the parents few repeats underwent reduction of copy numbers and even physical elimination. The sequences that suffered from eliminations were mostly endogenous retroviruses and pararetroviruses. The common feature of these labile sequences was their N. tomentosiformis origin. The work showed that genetic changes occur relatively rapidly after the formation of allopolyploid nucleus and may be targeted to the one subgenomic compartment.

Czech name

V syntetickém allotetraploidním tabáku dochází k preferenční eliminaci repetitivních sekvencí DNA, které mají původ v otcovském genomu N. Tomentosiformis

Czech description

V této publikaci jsme se zabývali genetickou analýzou repetitivní složky genomu v liniích syntetického tabáku. Bylo zjištěno, že zatímco většina sekvencí zůstává v nově syntetizovaném genomu nezměněna, u některých sekvencí jsme pozorovali výraznou redukci počtu kopií nebo dokonce i jejich fyzickou eliminaci. Jednalo se především o sekvence virového původu a některé satelity. Je zajímavé, že všechny takto postižené sekvence byly lokalizovány v jednom subgenomu původem z Nicotina tomentosiformis. Význam práce spočívá v poznatku, že genetické změny se mohou odehrát velmi brzy po vzniku hybridního jádra a to cíleně v jednom subgenomickém kompartmentu.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Cytogenetics and Cell Genetics

ISSN

0301-0171

e-ISSN

—

Volume of the periodical

166

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

CH - SWITZERLAND

Number of pages

13

Pages from-to

291-303

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—