Principles of RNA base pairing: Structures and energies of the trans Watson-Crick/sugar edge base pairs
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F05%3A00001190" target="_blank" >RIV/68081707:_____/05:00001190 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Principles of RNA base pairing: Structures and energies of the trans Watson-Crick/sugar edge base pairs
Original language description
In this study, the trans Watson-Crick/sugar edge (trans WC/SE) RNA base pair family has been characterized using quantum chemical and molecular mechanics calculations. Gas-phase optimized geometries from density functional theory (DFT) calculations and RIMP2 interaction energies are reported for the 10 crystallographically identified trans WC/SE base pairing patterns. Further, stable structures are predicted for all of the remaining six possible members of this family not seen in RNAs so far.
Czech name
Principy RNA párování bází: struktury a energie trans Watson-Crick/ sugar edge párů bází
Czech description
V této práci, trans Watson-Crick/sugar edge rodina byla charakterizovaná kvantově-chemickými a molekulově-dynamickými výpočty. Geometrie pro plynnou fázi byly optimalizované DFT výpočty a RIMP2 interakční energie byly vykázané pro 10 krystalograficky identifikovaných trans WC/SE vzorků. Dále byly předpovězeny stabilní struktury všech zůstávajících 6-ti možných členů této rodiny, které dosud nebyly pozorované
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
BO - Biophysics
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA203%2F05%2F0009" target="_blank" >GA203/05/0009: Structure and dynamics of DNA nitrogeneous bases, base pairs, oligonucleotides and their complexes with water, ions and drugs</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2005
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Volume of the periodical
109
Issue of the periodical within the volume
22
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
12
Pages from-to
11399-11410
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—