Structural and evolutionary classification of G/U wobble basepairs in the ribosome

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F06%3A00039009" target="_blank" >RIV/68081707:_____/06:00039009 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
Structural and evolutionary classification of G/U wobble basepairs in the ribosome
Original language description
We present a comprehensive structural, evolutionary and molecular dynamics (MD) study of G/U wobble pairs in the ribosome. These basepairs are classified according to their tertiary interactions and sequence conservation at their positions is determined.Specific interaction occurring in the G/U shallow groove pocket - like packing interaction (P-interaction) and some phosphate backbone interactions (phosphate-in-pockets interactions) lead to higher G/U conservation than others.
Czech name
Štrukturní a evoluční klasifikace G/U wobble párů bází v ribozómu
Czech description
Prezentujeme komplexní strukturu, evoluční a molekulově dynamickou (MD) studii G/U wooble párů bází v ribozómu. Tyto páry bází jsou klasifikované podle jejich terciárních interakcí. Sekvenční konzervace na jejich pozicích je určená. Specifická interakceobjevující se v úzkém žlábku G/U páru - těsná interakce (P-interakce) a fosfát backbone interakce (fosfát v kapse interakce) vedou ke zvýšené G/U konzervaci v porovnání s ostatními.

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
BO - Biophysics
OECD FORD branch
—

Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)