High intrachromosomal similarity of retrotransposon long terminal repeats: Evidence for homogenization by gene conversion on plant sex chromosomes?

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F07%3A00082342" target="_blank" >RIV/68081707:_____/07:00082342 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
High intrachromosomal similarity of retrotransposon long terminal repeats: Evidence for homogenization by gene conversion on plant sex chromosomes?
Original language description
We have analyzed long terminal repeats (LTRs) of recently discovered retrotransposon Retand that were amplified from microdissected X and Y chromosomes and autosomes of Silene latifolia. a majority of X- and Y-derived LTRs formed separate clades in phylogeneic tree. Intrachromosomal homogenity was stronger on the Y chromosome which could be explained by gene conversion working more intensively on the Y chromosome.
Czech name
Vysoká intrachromosomová podobnost dlouhých koncových repeticí: Důkaz homogenizace genovou konverzí na rostlinných pohlavních chromosomech?
Czech description
Analyzovali jsme dlouhé koncové repetice (LTR) nedávno objeveného retrotransposonu Retand, které byli amplifikované pomocí PCR na mikrodisektovaných chromosomech Y, X a autonomech Silene latifolia. Většina LTR odvozených z chromosomu X, resp. Y, tvořilaseparátní větve ve fylogenetickém stromu. Vnitrochromosomová homogenita LTR pocházejících z chromosomu Y byla mnohem vyšší než v případě chromosomu X. To si vysvětlujeme genovou konverzí vyšší na chromosomu Y.

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
BO - Biophysics
OECD FORD branch
—

Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)