Density-related changes in selection pattern for major histocompatibility complex genes in fluctuating populations of voles

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F07%3A00090913" target="_blank" >RIV/68081766:_____/07:00090913 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Density-related changes in selection pattern for major histocompatibility complex genes in fluctuating populations of voles

Original language description

We investigated whether two MHC class II genes (DQA1, DRB) were subjected to contemporary selection during increases in the density of fossorial water vole (Arvicola terrestris) populations. In the low-abundance phase, when populations were geographically isolated, both overall differentiation and isolation-by-distance were more marked for MHC genes than for neutral markers. Model-based simulations identified DQA1 as an outlier (i.e. under selection) in a single population, suggesting the action of local selection in fragmented populations. The differences between MHC and neutral markers gradually disappeared with increasing effective migration between sites. In the high-abundance year, DQA1 displayed significantly lower levels of overall differentiation than the neutral markers. Spatial and temporal fluctuations in parasite pressure and locus-specific selection are probably the most plausible mechanisms underlying the observed changes in selection pattern during the demographic cycle.

Czech name

Typ selekce působící na geny hlavního histokompatibilního systému u hrabošů závisí na hustotě

Czech description

V práci jsme sledovali, zda jsou MHC geny podrobeny selekci v průběhu populačního cyklu u hryzce vodního. V období nízké populační hustoty, kdy byly jednotlivé populace geograficky izolované, byly jak celková genetická diferenciace, tak i izolace vzáleností více signifikantně více zřetelné na MHC genech než na neutrálních znacích. Zároveň bylo prokázáno, že gen DQA1 je výrazně odlišný ("outlier") zejména v jedné populaci, což naznačuje působení lokální selekce. Tyto rozdíly mezi MHC a neutrálními znakyse postupně vytrácely s rostoucí hustotou. V roce vrcholové hustoty dokonce DQA1 gen vykazoval nižší diferenciaci než neutrální znaky. Jako možný mechanismus pozorovaných změn navrhujeme prostorové a časové změny v parazitárním tlaku a lokus-specifickouselekci.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/IAA600930608" target="_blank" >IAA600930608: The role of MHC in sexual selection - observational and experimental study in three model vertebrate species</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>R - Projekt Ramcoveho programu EK

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Molecular Ecology

ISSN

0962-1083

e-ISSN

—

Volume of the periodical

16

Issue of the periodical within the volume

23

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

14

Pages from-to

5084-5097

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—