TwoPhotonProcessor - software package for processing of in vivo calcium imaging data
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378041%3A_____%2F11%3A00373516" target="_blank" >RIV/68378041:_____/11:00373516 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
TwoPhotonProcessor - programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo
Original language description
Softwarový balík může sloužit jako nástroj pro zpracování dat z in vivo calcium imagingu. Z naměřených dat lze v programu dále vytvořit např. receptivní pole a post-stimulační histogramy pro jednotlivé neurony. Softwarový balík byl optimalizován pro použití pro měření ve sluchové kůře drobných hlodavců, může být ale využit i pro měření v jiných částech CNS.
Czech name
TwoPhotonProcessor - programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo
Czech description
Softwarový balík může sloužit jako nástroj pro zpracování dat z in vivo calcium imagingu. Z naměřených dat lze v programu dále vytvořit např. receptivní pole a post-stimulační histogramy pro jednotlivé neurony. Softwarový balík byl optimalizován pro použití pro měření ve sluchové kůře drobných hlodavců, může být ale využit i pro měření v jiných částech CNS.
Classification
Type
R - Software
CEP classification
FH - Neurology, neuro-surgery, nuero-sciences
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA309%2F07%2F1336" target="_blank" >GA309/07/1336: Acoustical signal processing in the neuronal circuits of the auditory system</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2011
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
TPP-1
Technical parameters
Programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo. Software je psaný jako provázané funkce v prostředí MATLAB. Pro běh programového balíku je nutné jádro MATLAB a Image Processing Toolbox (The MathWorks, Inc.)
Economical parameters
Vytvořený programový balík umožňuje plně automatické zpracování dat vápníkových signálů z neuronových sítí a originálním způsobem koriguje pohybové artefakty. V některých částech tohoto procesu je algoritmizace nezbytná, v jiných částech šetří mnoho hodin lidské práce při získávání receptivních polí jednotlivých neuronů.
Owner IČO
68378041
Owner name
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.