Global transcriptome analysis of the C57BL/6J mouse testis by SAGE: evidence for nonrandom gene order

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F05%3A00021168" target="_blank" >RIV/68378050:_____/05:00021168 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Global transcriptome analysis of the C57BL/6J mouse testis by SAGE: evidence for nonrandom gene order

Original language description

Gene expression profiles of total testis of adult C57BL/6J mice were generated using serial analysis of gene expression (SAGE). An extensive bioinformatic analysis of the total testis SAGE transcriptome and publicly available SAGE transcriptomes of testicular somatic cells and seven non-testis tissues was performed. The genes expressed in testicular tissues exhibited non-random distribution between autosomes and the X chromosome as well as certain tendency to form positional clusters on chromosomes. Theresults provide new evidence in favor of the theory of male-biased genes accumulation on the X chromosome in testicular somatic cells and indicate the opposite action of the meiotic X-inactivation in testicular germ cells.

Czech name

Globální transkriptomová analýza varlat myší C57BL/6J metodou SAGE: průkaz nenáhodného uspořádání genů

Czech description

Pomocí metody SAGE (sériová analýza genové exprese) byly vytvořeny genové expresní profily celých varlat dospělých myší kmene C57BL/6J. Byla provedena podrobná bioinformatická analýza SAGE transkriptomů celkového varlete a veřejně dostupných SAGE transkriptomů somatických buněk varlete a dalších sedmi somatických tkání. Geny exprimované v tkáních varlete vykazují nenáhodné uspořádání mezi autozomy a X chromozomem a také tendenci tvořit poziční klastry na chromozomech. Výsledky poskytují nový důkaz ve prospěch teorie o akumulaci samčích genů na X chromozomu v somatických buňkách varlete a ukazují protichůdné působení meiotické X inaktivace v germinálních buňkách varlete.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

B M C Genomics

ISSN

1471-2164

e-ISSN

—

Volume of the periodical

6

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

17

Pages from-to

29-45

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—