Nonrandom representation of sex-biased genes on chicken z chromosome

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F06%3A00048517" target="_blank" >RIV/68378050:_____/06:00048517 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Nonrandom representation of sex-biased genes on chicken z chromosome

Original language description

Several lines of evidence suggest that the X chromosome has an unusual complement of genes with sex-biased or sex-specific expression. However, the study of the X chromosome gene content in different organisms provided conflicting results. The most striking contrast concerns the male-biased genes, which are almost depleted from the X chromosome in Drosophila but overrepresented on the X chromosome in mammals. To elucidate the reason for these discrepancies, we analysed the gene content of the Z chromosome in chicken. Our analysis of the publicly available expressed sequence tags (EST) data and genome draft sequence revealed a significant underrepresentation of ovary-specific genes on the chicken Z chromosome. For the brain-expressed genes, we found a significant enrichment of male-biased genes but an indication of underrepresentation of female-biased genes on the Z chromosome. Comparison of X and Z chromosome gene contents provides new insight into evolution of sex chromosomes.

Czech name

Nenáhodné zastoupení genů spojených s určením pohlaví na kuřecím chromozomu

Czech description

Je známo, že chromosom X nese nenáhodný obsah genů s preferenční či výlučnou expresí v jednom pohlaví. Studie genového obsahu chromosomu X u různých organismů však přinesly rozporuplné výsledky. Nejnápadnější rozpor se týkal genů s preferenční expresí vsamčích tkáních, které se téměř nevyskytují na chromosomu X u drozofily, ale jsou nadměrně zastoupené na chromosomu X u savců. Abychom objasnili příčiny těchto nesrovnalostí, analyzovali jsme genový obsah chromosomu Z u kura domácího. Naše analýza veřejně dostupných expresních dat (expressed sequence tags ? ESTs) a genomové sekvence odhalila signifikantní ochuzení chromosomu Z o geny specifické pro vaječníky. Dále jsme zjistili ochuzení chromozomu Z o geny s preferenční expresí v samičím mozku, zatímcogeny přednostně exprimované v samčím mozku byly na chromozomu Z nadměrně zastoupené. Porovnání genového obsahu chromosomů X a Z poskytuje nový pohled na evoluci pohlavních chromosomů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1M0520" target="_blank" >1M0520: Center for Applied Genomics</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Molecular Evolution

ISSN

0022-2844

e-ISSN

—

Volume of the periodical

63

Issue of the periodical within the volume

5

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

6

Pages from-to

676-681

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—