The Constrained Longest Common Subsequence Problem for Degenerate Strings

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F07%3A03133390" target="_blank" >RIV/68407700:21230/07:03133390 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

The Constrained Longest Common Subsequence Problem for Degenerate Strings

Original language description

In this paper, we present a finite automata based algorithm for solving the constrained longest common subsequence problem for degenerate strings. A string is a sequence of symbols from a given alphabet. A subsequence u of a string x is obtained by deleting some characters from x (not necessarily contiguous). Given two strings x and y, u is a common subsequence of x and y, if u is a subsequence of both x and y. And, u is a longest common subsequence (LCS) of x and y, if it is the longest among all suchsubsequences. Given two strings x and y, the LCS problem aims to compute a longest common subsequence of them. We study a newer variant of the classic LCS problem, namely the Constrained LCS problem (CLCS). In CLCS, the computed longest common subsequence must also be a supersequence of a third given string, say z.

Czech name

The Constrained Longest Common Subsequence Problem for Degenerate Strings

Czech description

V tomto článku je popsaný algoritmus pro výpočet nejdelší omezené společné podposloupnosti pro zobecněné řetězce, algoritmus je založený na konečných automatech. Řetězec je posloupnost symbolů z dané abecedy. Podposloupnost u řetězce x lze získat vymazáním některých symbolů z x. Pro dva dané řetězce x a y je řetězec u společnou podposloupností jestliže u je zároveň podposloupností retězce x i řetězce y. Řetězec u je nejdelší společnou podposloupností x a y (LCS) pokud je nejdelší ze všech takových řetězců. Ve článku je popsané řešení variany klasického problému LCS, konkrétně omezená nejdelší společná podposloupnost (CLCS). V této variantě je úkolem nalezení takové nejdelší společné podposloupnosti, která je zároveň nadposloupnost třetího řetězce z.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

IN - Informatics

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA201%2F06%2F1039" target="_blank" >GA201/06/1039: Text processing and analysis</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Twelfth International Conference on Implementation and Application of Automata

ISBN

978-3-540-76335-2

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

3

Pages from-to

309-311

Publisher name

Springer-Verlag

Place of publication

Berlin

Event location

Prague

Event date

Jul 16, 2007

Type of event by nationality

EUR - Evropská akce

UT code for WoS article

—