Ontologies in Annotation and Analysis of Medical Records

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F08%3A03141897" target="_blank" >RIV/68407700:21230/08:03141897 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Ontologies in Annotation and Analysis of Medical Records

Original language description

Patients health records offer a rich source of information about the diseases, their symptoms and development. However, most of the records currently available are in form of semi structured text files the content of which cannot be accessed by technicalmeans in a straightforward way. In order to apply some automated reasoning techniques, the content of the patient record has to be transformed from the textual form into a new machine-understandable format. Our intention is to use for that purpose OWL formalism. The knowledge base in OWL is created by means of semantic annotation using ontologies. Instances of this knowledge base can be exported to a relational database. Due to specific features of medical language, the current natural language processing techniques do not allow us to perform this annotation automatically. Medical records Annotation Tool (MedAT) provides a framework for semiautomatic semantic annotation of patients records.

Czech name

Ontologie pro anotaci a analýzu lékařských záznamů

Czech description

Lékařské záznamy nabízí bohatý zdroj informací o nemocech, jejich symptomech a průběhu. Bohužel většina záznamů je dostupná pouze ve formě textového souboru nebo pouze v papírové podobě, což jsou formáty, které nelze jednoduše počítačově zpracovat. V tomto článku představujeme systém MedAT (Medical Annotation Tool) jako podpůrný nástroj pro převod lékařských záznamů do strukturované formy, která je vytvořena systémem ontologií v OWL formalismu.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

JC - Computer hardware and software

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1ET101210513" target="_blank" >1ET101210513: Relational machine learning for analysis of biomedical data</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Distributed Human-Machine Systems

ISBN

978-80-01-04027-0

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

6

Pages from-to

—

Publisher name

CTU Publishing House

Place of publication

Praha

Event location

Athens

Event date

Mar 9, 2008

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—