All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Efficient integrative analysis of molecular data with miXGENE

The result's identifiers

  • Result code in IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F16%3A00309816" target="_blank" >RIV/68407700:21230/16:00309816 - isvavai.cz</a>

  • Result on the web

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternative languages

  • Result language

    čeština

  • Original language name

    Zefektivnění veřejného systému miXGENE pro integrativní analýzu molekulárních dat

  • Original language description

    Molekularn klasikace biologickych vzorku na zaklade jejich anotovanych prolu genove exprese [14] je prirozenou ulohou. Pres prokazatelne uspechy [12] jde vsak o ulohu obtznou, zejmena vzhledem k cene genovych cipu a nzkemu poctu biologickych vzorku, vysokemu poctu sledovanych genu a nepresnostem v meren. Ulohy s temito charakteristikami casto vedou k preucen, kdy klasikatory dostatecne nezobecnuj a namsto zakladnch vztahu popisuj nahodile vazby v trenovacch datech. Resenm je regularizace, tedy zaveden dodatecne znalosti, nebo hromadne ucen bez ucitele z sirs skaly verejnych nekuratovanych biologickych vzorku. Pak jde o ulohu velmi vypocetne narocnou. Nas vyzkumny tym se dlouhodobe zabyva nekolika tematy. Prvnm je vyuzit apriorn molekularn znalosti k vytvaren odvozenych prznaku reprezentujcch funkcne ci jinak prbuzne mnoziny genu. Znalost mohou byt zname anotace genu, vzajemne regulacn vztahy mezi geny, vztahy mezi jejich blkovinnymi produkty, znalost transkripcnch faktoru, apod. Hlavn otazky jsou zrejme: 1) jak skupiny genu tvorit, 2) jak poctat jejich skupinovou expresi a 3) jak vybrat vhodne odvozene prznaky pred samotnym ucenm. Clem je maximalizovat presnost molekularnch klasikatoru zalozenych na odvozenych prznacch a take jejich srozumitelnost pro biology.

  • Czech name

    Zefektivnění veřejného systému miXGENE pro integrativní analýzu molekulárních dat

  • Czech description

    Molekularn klasikace biologickych vzorku na zaklade jejich anotovanych prolu genove exprese [14] je prirozenou ulohou. Pres prokazatelne uspechy [12] jde vsak o ulohu obtznou, zejmena vzhledem k cene genovych cipu a nzkemu poctu biologickych vzorku, vysokemu poctu sledovanych genu a nepresnostem v meren. Ulohy s temito charakteristikami casto vedou k preucen, kdy klasikatory dostatecne nezobecnuj a namsto zakladnch vztahu popisuj nahodile vazby v trenovacch datech. Resenm je regularizace, tedy zaveden dodatecne znalosti, nebo hromadne ucen bez ucitele z sirs skaly verejnych nekuratovanych biologickych vzorku. Pak jde o ulohu velmi vypocetne narocnou. Nas vyzkumny tym se dlouhodobe zabyva nekolika tematy. Prvnm je vyuzit apriorn molekularn znalosti k vytvaren odvozenych prznaku reprezentujcch funkcne ci jinak prbuzne mnoziny genu. Znalost mohou byt zname anotace genu, vzajemne regulacn vztahy mezi geny, vztahy mezi jejich blkovinnymi produkty, znalost transkripcnch faktoru, apod. Hlavn otazky jsou zrejme: 1) jak skupiny genu tvorit, 2) jak poctat jejich skupinovou expresi a 3) jak vybrat vhodne odvozene prznaky pred samotnym ucenm. Clem je maximalizovat presnost molekularnch klasikatoru zalozenych na odvozenych prznacch a take jejich srozumitelnost pro biology.

Classification

  • Type

    V<sub>souhrn</sub> - Summary research report

  • CEP classification

    JC - Computer hardware and software

  • OECD FORD branch

Result continuities

  • Project

  • Continuities

    N - Vyzkumna aktivita podporovana z neverejnych zdroju

Others

  • Publication year

    2016

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data specific for result type

  • Number of pages

    7

  • Place of publication

    Praha

  • Publisher/client name

    CESNET, zájmové sdružení právnických osob

  • Version