Refinement: necessary tool for studies of complexes of proteins with ligands
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21340%2F22%3A00360992" target="_blank" >RIV/68407700:21340/22:00360992 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Upřesňování: nezbytný nástroj při studiu vazeb komplexů proteinů s ligandy
Original language description
Rentgenová strukturní analýza umožňuje studovat vazby mezi ligandem a proteinem na atomární úrovni, čímž může nejen významně přispět k objasnění funkce studovaného proteinu, ale i identifikovat jeho potenciální inhibitory. Tato práce se věnovala dvěma komplexům ligandu s nukleasou ze Stenotrophomonas maltophilia. Především pak upřesňování strukturních modelů a vlivu upřesňování na nalezení pozice ligandu v aktivním místě této nukleasy. Postupným upřesňováním strukturních modelů bylo možné přesněji identifikovat místo a způsob navázání studovaných ligandů. Přesné určení pozice modelovaného ligandu v aktivním místě bylo diskutováno pomocí map elektronové hustoty vypočtených několika způsoby a vzhledem k pozorovaným interakcím mezi ligandem a vazebným místem nukleasy.
Czech name
Upřesňování: nezbytný nástroj při studiu vazeb komplexů proteinů s ligandy
Czech description
Rentgenová strukturní analýza umožňuje studovat vazby mezi ligandem a proteinem na atomární úrovni, čímž může nejen významně přispět k objasnění funkce studovaného proteinu, ale i identifikovat jeho potenciální inhibitory. Tato práce se věnovala dvěma komplexům ligandu s nukleasou ze Stenotrophomonas maltophilia. Především pak upřesňování strukturních modelů a vlivu upřesňování na nalezení pozice ligandu v aktivním místě této nukleasy. Postupným upřesňováním strukturních modelů bylo možné přesněji identifikovat místo a způsob navázání studovaných ligandů. Přesné určení pozice modelovaného ligandu v aktivním místě bylo diskutováno pomocí map elektronové hustoty vypočtených několika způsoby a vzhledem k pozorovaným interakcím mezi ligandem a vazebným místem nukleasy.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
—
OECD FORD branch
10302 - Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.)
Result continuities
Project
<a href="/en/project/EF16_019%2F0000778" target="_blank" >EF16_019/0000778: Center for advanced applied science</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Sborník příspěvků 11. studentské vědecké konference fyziky pevných látek a materiálů
ISBN
978-80-01-07079-6
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
5
Pages from-to
52-56
Publisher name
katedra inženýrství pevných látek
Place of publication
Praha
Event location
Praha, FJFI
Event date
Sep 12, 2022
Type of event by nationality
CST - Celostátní akce
UT code for WoS article
—