Mapování interakcí mRNP-NUP během jaderného exportu pomocí unikátního přístupu mRNA-trap

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202100007

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

21-19503J

Název projektu anglicky

Mapping mRNP-NUP interactions during nuclear export with a unique mRNA-trap

Anotace anglicky

Eukaryotic mRNAs need to pass through the nuclear pores to reach the cytoplasm. Study of nuclear mRNA export is challenging, because it is fast, and interactions are transient. We recently found that trypanosomes lack the checkpoint that usually prevents immature mRNAs from starting nuclear export. As a consequence, messenger ribonucleoprotein particles (mRNPs) can be trapped while being exported by blocking transcription or splicing. Here, we plan to employ this unique feature as an mRNA trap, applying novel proximity labeling and classical interactomics techniques, to create a comprehensive, high-resolution map of interactions between nuclear pore proteins and mRNPs in transit. Despite the evolutionary distance, the basic structure of the nuclear pore is conserved, and findings are likely transferrable to opisthokonts. Conversely, our approach will elucidate differences in mRNA export between systems and mechanisms that are unique to the parasite, advancing knowledge on mRNA export evolution, and those that represent vulnerable processes employable for drug development.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2021

Ukončení řešení

31. 12. 2023

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

6. 3. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GC-R

Datum dodání záznamu

21. 5. 2024

Celkové uznané náklady

6 437 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 437 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč