Center for Applied Genomics
Project goals
We propose to establish a research Center of Applied Genomics (CAG), where a high level research of genomics will be oriented towards practical applications. The program of the Center is based on the experience obtained in the Center of Integrated GenomiThe effort would be focused in CAG to two areas. The first one would be medically oriented projects aimed particularly at new diagnostic methods and the second one on projects targeted to the topic of the environment. Both these areas were already develoAn example of such an ongoing CIG project is construction of a mitochip on which oligonucleotide markers of all genes of the human mitochondrion are anchored. With regard to the long-term program of the study of inherited mitochondrial diseases performedAdvantageous is here experience with these diseases as well as a comprehensive register of patients in the Czech Republic and abroad. Another example of a well-developed topic is the study of bacterial genes determining degradation of catechols and synt
Keywords
Genomicsproteomicsmicroarraysbioremediationinborn errorsmitochondria
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
The research centres (National research program)
Call for proposals
Výzkumná centra 1 (SMSM2005001M1)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14/2010-31
Alternative language
Project name in Czech
Centrum aplikované genomiky
Annotation in Czech
Navrhujeme vytvořit výzkumné Centrum aplikované genomiky (CAG), v němž se skloubí vysoká úroveň genomického výzkumu s výzkumem orientovaným na praktické aplikace. Program Centra je založen na zkušenostech získaných v Centru integrované genomiky (CIG) v lV CAG by se úsilí soustředilo do dvou oblastí. Jednak by to byly lékařsky orientované projekty, zaměřené zejména na nové diagnostické metody, a dále projekty cílené do problematiky životního prostředí. Oba tyto směry jsou právě díky CIG rozpracovány a doJako příklad takového projektu již řešeného v CIG lze uvést konstrukci mitočipu, na němž jsou zakotveny oligonukleotidové značky všech genů lidské mitochondrie. Vzhledem k dlouhodobému programu studia dědičných mitochondriálních chorob na 1. LF UK a na FVýhodou je zde nejen zkušenost s těmito chorobami ale i dokonalý přehled o pacientech v ČR i v zahraničí). Jiným příkladem rozvinuté tematiky je studium bakteriálních genů determinujících jednak degradaci katecholů a též syntézu polyhydroxyalkanoátů).
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Using methods of functional genomics molecular changes leading to several diseases were characterized. In particular this applies to porphyrias, juvenile nephropaties and diseases connected with ATP synthesis. New methods were developed for gene transferto cells. They are based on envelope proteins of selected retroviruses. The results are subjects of excellent scientific papers and patents
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 3, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-MSM-1M-U/01:1
Data delivery date
Jul 3, 2012
Finance
Total approved costs
215,209 thou. CZK
Public financial support
193,443 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
21,766 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
215 209 CZK thou.
Public support
193 443 CZK thou.
89%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2005 - 31. 12. 2011