Glial cells- the key players in the progression of amyotrophic lateral sclerosis
Project goals
A striking functional heterogeneity exists within astrocytes, NG2-glia, oligodendrocytes and microglia. It is presented in various subpopulations that are characterized by distinct gene expression profiles, functional properties and their possible role in neurodegenerative disease progression. We aim to clarify the heterogeneity and function of glial cells in the progression of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) using transgenic mice carrying superoxide dismutase mutation and fluorescently labeled glia. A powerful high throughput single cell (SC) sequencing platform will be used to discover subpopulations within each glial cell type based on their gene expression profiles and functional characterization. Using advanced multivariate and multiway modeling, we aim to construct a dynamic model of CNS degeneration in ALS progression with resolution down to the single glial cell. The SC expression profiling combined with the data mining and modeling will provide a powerful approach to identify important and novel expression pathways for development of glia-oriented therapeutic strategies.
Keywords
AstrocytesmicrogliaNG2 gliaoligodendrocytesmotoneuronsmotoric cortexspinal cordnext generation sequencingdemyelinizationamyotrophic lateral sclerosisneurodegenerationglial functional propertiesionic/neurotransmitter homeostasis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-02046S
Alternative language
Project name in Czech
Gliové buňky- klíčoví hráči v progresi amyotrofické laterální sklerózy
Annotation in Czech
Astrocyty, NG2 glie, oligodendrocyty a mikroglie, vykazují značnou funkční heterogeneitu, která se odráží v přítomnosti různých subpopulací lišících se v profilech genové exprese, jejich funkčních vlastnostech, ale i v jejich podílu na rozvoji neurodegenerativních onemocnění. Cílem projektu je objasnit úlohu gliových buněk v progresi amyotrofické laterální sklerózy (ALS) s použitím transgenních myší nesoucích mutaci superoxid dismutázy a současně umožňujích vizualizaci gliových buněk. S použitím vysokoúčinné platformy na analýzu jednotlivých buněk pomocí sekvenování nové generace budou charakterizovány subpopulace jednotlivých typů gliových buněk a následně i funkčně charakterizovány. S využitím pokročilých způsobů analýzy navrhneme dynamický model degenerace CNS v průběhu ALS na úrovni jednotlivých gliových buněk. Profilování exprese jednotlivých buněk a modelování jejich interakcí tak poskytne velmi účinný přístup pro identifikaci/charakterizaci nových důležitých genů a regulačních drah u gliových buněk, na které se může zaměřit budoucí vývoj terapeutických postupů.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Jun 9, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
9,950 thou. CZK
Public financial support
9,734 thou. CZK
Other public sources
216 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
9 950 CZK thou.
Public support
9 734 CZK thou.
97%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Neurosciences (including psychophysiology)
Solution period
01. 01. 2019 - 31. 12. 2023