Identification and characterization of genetic factors contributing to inherited tubulointerstitial kidney disease II
Project goals
Autosomal dominant tubuloinsterstitial kidney diseases (ADTKD) refers to a clinical syndrome characterized by autosomal dominant inheritance, pathologic tubular changes and interstitial fibrosis resulting in slowly progressive chronic kidney disease. The rate of progression is very variable in individual patients between as well as within families – something that is not yet understood – with individuals requiring renal replacement therapy between the 3rd and 5th decades of life. There are four major conditions as cause of ADTKD: mutation in UMOD, REN, MUC1 or SEC61A1 gene. Genetic studies suggested that mutations in the ADTKD genes may be the third most common cause of inherited kidney disease after autosomal dominant polycystic kidney disease and Alport syndrome. We established an international registry of >1000 families with various forms of inherited kidney diseases. Using modern genetic approaches, we have identified the primary causes of inherited kidney disease, resulting in a genetic diagnosis in over 500 families. The aim of the project is to increase awareness on ADTKD among specialists and patients, expand existing cohort of patients and biologic materials, identify genetic diagnosis in affected families, understand the disease process on molecular level, identify factors affecting progression of the disease in individual patients and evaluate performance of the cystatin C, plasma UMOD, plasma MUC1, plasma CRELD2, and urinary UMOD as biomarkers monitoring the disease activity. The project should enhance knowledge on genetic architecture of ADTKD, determine the pathophysiology, and provide information and methods that are essential in the development of future clinical trials.
Keywords
sekvenování nové generaceNext generation sequencingchronické onemocnění ledvinchronic kidney diseaseLedvinydědičné tubulointersticiální nefropatieanalýza DNAKidneyinherited tubulointerstitial nephropathyDNA analysisKorelace getypu a fenotypuGenotype and phenotype correlation
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202100001
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU21-07-00033
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace a charakterizace genetických faktorů dědičného tubulointersticiálního onemocnění ledvin II
Annotation in Czech
Autosomálně dominantní tubulointersticiální onemocnění ledvin (ADTKD) je klinický syndrom charakteristický autozomálně dominantní formou dědičnosti, patologickými změnami ledvinných tubulů, fibrózou intersticia dřeně ledvin a postupnou ztrátou funkce ledvin. Progrese onemocnění je individuálně velmi různá jak mezi rodinami, tak i v rámci jednotlivých rodin, a vede ve 3.–5. dekádě života k selhání ledvin vyžadující dialýzu a transplantaci ledvin. Většina případů ADTKD je způsobena mutacemi čtyř genů kódujících uromodulin (UMOD), mucin-1 (MUC1), preprorenin (REN) a podjednotku alfa 1 proteinového translokonu SEC61 (SEC61A1). Genetické studie naznačují, že mutace ADTKD genů jsou po polycystóze a Alportovu syndromu třetí nejčastější příčinou dědičně podmíněných onemocnění ledvin. V rámci dlouholeté spolupráce jsme vytvořili mezinárodní registr >1000 rodin s dědičným onemocněním ledvin. Pomocí moderních genetických postupů se nám podařilo určit genetické příčiny a diagnózu u > 500 rodin. Cílem projektu je využít Internet a relevantní informační zdroje ke zvýšení povědomí o ADTKD u veřejnosti a odborníků, rozšířit registr rodin a pacientů s dědičným onemocněním ledvin, objasnit genetické příčiny nemoci v těchto rodinách, porozumět molekulárním mechanismům nemoci, identifikovat faktory ovlivňující variabilitu ve věku nástupu a rychlosti progrese selhání ledvin, analyzovat biologický materiál od pacientů v různém stupni selhání ledvin a určit potenciál plasmatických koncentrací cystatinu C, uromodulinu, mucinu-1 a CRELD2 jako možných biomarkerů informujících o progresi onemocnění. Řešení projektu by mělo přinést nové poznatky o genetické architektuře ADTKD a patofyziologii nemoci. Získané poznatky a zavedené metody by měly umožnit včasnou diagnózu a přípravu protokolů klinických studií.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NU-R
Data delivery date
Feb 21, 2024
Finance
Total approved costs
12,844 thou. CZK
Public financial support
12,844 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
12 844 CZK thou.
Public support
12 844 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Health
OECD FORD
Human genetics
Solution period
01. 05. 2021 - 31. 12. 2024