Study of phytopathogenes occurrence and its genetic variants
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The supprot of targeted research projects (National proramme of research)
Call for proposals
Podpora projektů cíleného výzkumu 1 (SAV02005-CI)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
1QS500510558
Alternative language
Project name in Czech
Studium výskytu fytopatogenů a jejich genetických variant
Annotation in Czech
Budou studovány molekulární varianty viroidů chmelu HLVd, HSVd a bramboru PSTVd, jejich potenciál k šíření a adaptaci na plevelné druhy rostlin. Dále budou studovány projevy patogeneze vyvolané molekulárními formami těchto viroidů a dynamika jejich populací specifickými diagnostickými metodami. V projektu bude dále provedena diagnostika molekulárních forem viroidů révy vinné HSVd, GYSVd, ovocných dřevin ASSVd, ADFVd, PLMVd a okrasných rostlin CSVd. Bude proveden skríning výskytu, identifikace a charakterizace virů ACLSV, ASPV, ASGV, fytoplazem a bakterií rodu Erwinia ve šlechtitelském materiálu a genofondu jabloní popř. hrušní VŠÚO a v plevelných hostitelích kombinací molekulárních a klasických biologických metod (PCR, RT-PCR, rep-PCR, dot-blot hybridizace, sekvenování, roubování, mechanická inokulace, ELISA, TEM). Budou vyvinuty a předány metodiky pro rutinní testování zjištěných patogenů molekulárními technikami, budou navržena fytokaranténní opatření při zjištění patogenů.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Methods of viroids, viruses, phytoplasmas, E. amylovora detection, protocols about prophylaxis of hop viroids spread were published, database of viroid cDNA was supplied, presence of pathogens in apple, pear trees and wild growing plants was screened.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 11, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-AV0-1Q-U/01:1
Data delivery date
Apr 15, 2010
Finance
Total approved costs
7,192 thou. CZK
Public financial support
7,039 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
153 thou. CZK