Mechanisms of parasitic RNA propagation and elimination in male germline studied on economically important viroid species.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
International projects
Call for proposals
Mezinárodní projekty 13 (SGA0201800003)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-10515J
Alternative language
Project name in Czech
Mechanismus propagace a eliminace parazitické RNA u samčí zárodečné linie při studiu u hospodářsky významného druhu viroidu.
Annotation in Czech
Samčí zárodečná linie vyšších rostlin hraje klíčovou roli v pohlavním rozmnožování a tím v zajištění plodnosti rostlin a zemědělských plodin při produkci a transportu gamet, oplození, tvorbě semen i očistnou roli díky účinným mechanismům eliminace parasitických nukleových kyselin v pylu, čímž je zabráněno jejich přenosu do další generace. Některé viroidy, parazitické cirkulární molekuly RNA, se adaptovaly na překonání těchto umlčovacích mechanismů a proto mohou být pylem přenosné nebo nepřenosné v závislosti na kombinaci patogen-hostitel. Dosud nejsou známé informace o molekulárních interakcích viroidů na úrovni samčí zárodečné linie, lze je však předpokládat na základě mechanismů zahrnujících malé RNA. Zde bude studován chmelový izolát viroidu jabloní AFCVd, jenž infikuje modelového hostitele Nicotiana tabacum, kde dochází v jeho samčí zárodečné linii k supresi viroidní propagace. Jde proto o vhodný model pro analýzy transkriptomu, degradomu a proteomu s cílem charakterizovat během vývoje interakce parazitické viroidní RNA v pylu a pochopit mechanismus vedoucí k její eliminaci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project aims were achieved. The results achieved contributed to elucidation of mechanisms behind elimination of viroid parasitic RNA from male germline. TFIIIA was confirmed as a key factor employed by parasitic RNA to adapt to host metabolism. A position of degradome in the process was shown. No significant weaknesses in compliance with the rules or fund usage were found.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 15, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GC-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
11,036 thou. CZK
Public financial support
10,556 thou. CZK
Other public sources
480 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK