Transposable elements regulation in plant germlines
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-00364S
Alternative language
Project name in Czech
Regulace transponovatelných elementů v zárodečné dráze rostlin
Annotation in Czech
Ačkoli jsou transponovatelné elementy (TE) umlčeny v somatických buňkách, v zárodečné dráze dochází v důsledku epigenetického reprogramování genomu k dočasné aktivaci transpozonů. Rostliny si vyvinuly obranné mechanismy proti škodlivé inzerční aktivitě TE v této kritické fázi života, ale zůstává záhadou, jak tyto mechanismy ovlivňují mezigenerační množení TE v samčí a samičí rodičovské linii. Cílem projektu je ukázat, že se TE u rostlin šíří buď v otcovské nebo mateřské linii a identifikovat zodpovědné epigenetické mechanismy. Pomocí FISH a bioinformatické analýzy osekvenovaných genomů budeme studovat počty různých TE na pohlavních chromozomech několika dvoudomých rostlin. Dále prozkoumáme transkripční aktivitu TE a krátkých regulačních RNA během životního cyklu modelové dvoudomé rostliny Silene latifolia a to s využitím moderních sekvenačních metod DNA a RNA, bioinformatických analýz a experimentů využívajících transgenní rostliny. Pohlavně specifické šíření TE je u tradičních hermafroditních rostlinných modelů skryté. Naší ambicí je prokázat jeho existenci a všudypřítomnost.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
—
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
8,391 thou. CZK
Public financial support
8,391 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK