Sex-specific proliferation of transposable elements in plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-15609S
Alternative language
Project name in Czech
Pohlavně specifické šíření mobilních elementů u rostlin
Annotation in Czech
Transpozony jsou po většinu života rostliny udržovány v neaktivním stavu, ale během vývoje rostlinné zárodečné dráhy dochází k epigenetickému reprogramování genomu a dočasné aktivaci transpozonů. Tato dočasná aktivace transpozonů je kompenzována epigenetickými mechanizmy, jež brání transpozonům zvyšovat počet kopií v genomu rostliny, ale dosud se neví, jestli a jak se liší jejich účinnost v samčí a samičí zárodečné dráze. Cílem projektu je prokázat, že se liší a že většina transpozonů se šíří přednostně buď v samčí nebo samičí zárodečné dráze. Pomocí FISH, průtokové cytometrie a bioinformatických analýz budeme studovat počty transpozonů na pohlavních chromozomech modelové rostliny Silene latifolia. Prostřednictvím křížení transgenních a mutantních rostlin popíšeme epigenetický mechanizmus zodpovědný za šíření vybraného transpozonu pouze v samičí linii. Na základě našich předchozích studií předpokládáme, že je pohlavně specifické šíření transpozonů běžné u všech rostlin a že je důsledkem koevoluce transpozonů a epigenetických mechanizmů, jež chrání genom rostlinného gametofytu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
8,306 thou. CZK
Public financial support
8,306 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK