Gene dosage compensation and DNA methylation
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Kompenzace dávky genů a metylace DNA
Annotation in Czech
Většina druhů vyšších rostlin se vyznačuje jadernými genomy s vysokým obsahem metylcytozinu. Recentní studie naznačují, že alely strukturních genů spolu mohou interagovat, což má za následek ztrátu exprese jedné nebo více alel. Inaktivace genů přitom obvykle koreluje s jejich hypermetylací. Modelovým příkladem genových interakcí je kompenzace dávky genů, nesených chromozomy X v diploidních buňkách homogametických samic u řady živočišných druhů. Naše výsledky u dvoudomého rostlinného druhu Melandrium album, který se vyznačuje savčí X/Y pohlavní determinací, naznačují existenci negativního kompenzačního mechanizmu: jeden ze dvou samičích X chromozomů je hypermetylován, heterochromatinizován a replikuje se v pozdní S fázi. V předpokládaném projektu bude tato hypotéza testována na molekulární úrovni s pomocí X - specifických sekvencí DNA. Metylace a exprese těchto sekvencí budou sledovány zejména v závislosti na počtu kopií chromozomu X u samičích rostlin různého stupně ploidie.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Projekt přinesl celou řadu prioritních poznatků o regulaci genové exprese u vyšších rostlin.Bylo zjištěno, že inaktivované oblasti rostlinného genomu se vyznačují odlišnou strukturou chromatinu a to zejména vyšším obsahem 5-metylcytozinu a nižším obsahem
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 1998
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
3,525 thou. CZK
Public financial support
3,147 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK