Genome dynamics in the context of sex chromosome evolution in the genus Humulus
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-00301S
Alternative language
Project name in Czech
Dynamika genomů v kontextu evoluce pohlavních chromozomů u rodu Humulus
Annotation in Czech
Pohlavní chromozomy se vyvinuly během evoluce mnohokrát a to jak u rostlin, tak u živočichů. Mnoho studií ukazuje, že odlišné druhy sdílí některé základní charakteristiky formování pohlavních chromozomů, zatímco příbuzné druhy se mohou velmi lišit. Naším záměrem je studovat dynamiku genomů dvou blízce příbuzných dvoudomých druhů, Humulus lupulus a H. japonicus. Mezi nejvýraznější a nejzajímavější rozdíly u těchto druhů patří variabilita ve velikosti genomů, odlišnost v počtu autozomů a odlišnosti u pohlavních chromozomů (XX/XY1Y2 u H. japonicus a XX/XY u H. lupulus). Použitím průtokové cytometrie, sortování a sekvenování pohlavních chromozomů, komparativní cytogenomiky a bioinformatických nástrojů určíme, které repetice jsou klíčové pro variabilitu velikosti genomů, a které pro utváření pohlavních chromozomů. Naše studie přinese nejenom nové poznatky o dynamice genomů u studovaných druhů, ale porovnání s ostatními rostlinami s pohlavními chromozomy nám umožní identifikovat obecné procesy, které formují a regulují rostlinné genomy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 6, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
10,868 thou. CZK
Public financial support
10,868 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK